Molekulaar- ja rakubioloogia ning genoomika teadlased tegid kokkuvõtte möödunud teadusaastast
22.–23. jaanuarini leidis Omicumi õppe- ja teadushoones aset Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi (MRI) ning genoomika instituudi (GI) aastakonverents.
Aastakonverents on traditsiooniline teadusaasta kokkuvõte mõlema instituudi poolt, mis annab eeskätt noorteadlastele võimaluse esitada oma teadustulemusi suure auditooriumi ees ning saada oma stendiettekannetele väärtuslikku tagasisidet.
Kaks instituuti on aastakonverentsi korraldanud juba üle 30 aasta, esimest korda toimus konverents Eesti doktorikooli egiidi all. Lisaks Tartu Ülikooli nooremteaduritele osalesid ka Eesti Maaülikooli ja Tallinna Tehnikaülikooli teadlased.
Konverentsi tööd juhtis žürii, kes valis doktorantide poolt esitatud teeside hulgast välja suulise ettekande pidajad, neid oli kahe päeva peale kokku 13. Suulise ettekande võimalus anti lisaks ka mitmele noorema põlvkonna teadlasele, kellel doktoriõpingud seljataga. Kõik ülejäänud teesid esitanud doktorandid said võimaluse posterettekandeks, kokku esitleti neid 36. Postreid tutvustati lühikeste, kahemintutiliste välkkõnedena ning seejärel oli autoritel kohvipauside ajal võimalus oma uurimisteemasid huvilistele põhjalikumalt selgitada.
- Harleen Kaur - Impact of Antimicrobial Coatings on the Microbial Communities of High-Touch Communal Surfaces
- Ashna Anilkumar - Temporal dynamics of BMP signalling during tissue morphogenesis in Drosophila wing vein development
- Apostol Apostolov - Semaglutide reprograms the metabolism at the embryo–endometrium interface
- Biancamaria Bonucci - Evaluation of different extraction protocols for DNA yield from ancient dental calculus
- Anastasiia Bratchenko - Genetics of individual hormonal sensitivity in women
- Toni de-Dios - A case of Dog Vibriosis infection from Jamestown’s Starving Time, 1609 to 1610
- Roberto Didonna - A genetic bridge over the Gulf of Finland: tracing the origin of genetic connectedness between Finns and Estonians
- Jelisaveta Džigurski - The impact of genetic factors and hormonal contraceptives on venous thromboembolism: an extended Cox model analysis in the Estonian Biobank
- Jéssica Figuerêdo Campos De Jesus - Genome-Wide Analysis of 64 Male Reproductive Phenotypes Reveals Novel Loci and Shared Biological Pathways
- Jose Rodrigo Flores Espinosa - Signatures of selection and adaptation in an Arctic Circle population
- Anette Hallik - In vitro reassociation of eucaryotic ribosomal subunits as a versatile molecular investigation method
- Johanna Hendrikson - GacS always and forever
- Mariliis Hinnu - Phage labelling in Pseudomonas putida
- Anne-Mai Ilumäe - Maternal contacts around & across the Baltic Sea - thousands of complete mtDNA sequences reveal the layered formation of the maternal genepool in the Circum-Baltic
- Kerli Ilves - Genetic architecture of the Big Five personality traits and their associations with health behaviours
- Aleksandra Judin - Genome-Wide Association Study Meta-Analysis of Psoriatic Arthritis Across Large Biobank and Population Cohorts
- Ivan Kuznetsov - Sex-specific associations of educational attainment polygenic score with lifetime fertility in Estonia
- Liina Kuus - Biofilm formation of wild-type dairy strains
- Alicja Cecylia-Lewańczyk, The opposite effects of the stringent response on phage infection of Pseudomonas putida
- Birgit Malken - Predicting weight loss from a diverse set of biological, behavioural, and psychological factors
- Elise Mägi - Mapping phage defense systems of Pseudomonas putida
- Telver Objärtel - Early detection of cancer via circulating tumor DNA sequencing and methylation analysis
- Triinu Ojalo - Latent Mental-Health and Behavioural Risk Profiles in the EstBB Cohort: Differential Associations with Attention-Deficit/Hyperactivity Disorder and Cardiometabolic Diseases
- Kateryna Pantiukh - Species structure of human gut microbiome species:
Implications for association studies in large cohorts - Sandra Park - Short semi-lethal exposure to ionic and metallic copper or silver results in survival of antibiotic-tolerant Escherichia coli sub-populations
- Rutvi Manishkumar Rajpara - Investigating the evolutionary dynamics underlying DNA virus immune response
- Valentina Rukins - Genetic determinants associated with changes in the structure and function of cutaneous microvasculature
- Gea Maris Räis - Identification of promoters and expression of lapG, a gene essential for Pseudomonas putida biofilm formation
- Joonas-Sande Tamm - A systematic analysis of genetic contributions and cross-condition associations in eye diseases
- Karmel Teder - Comparison of methods for absolute risk prediction in the presence of competing risks, using the example of Type 2 Diabetes in the Estonian Biobank cohort.
- Elia Tiso - Recent developments for context-specificity in PRS
- Kai Tätte - Genetic Origins of the Kiritimati Population from Micronesia
- Sigrit Umerov - Antimicrobial Silver Sensitivity of Silver or Copper Surface Adapted Escherichia coli Isolates
- Jaan Vihalemm - Selective Bioleaching of Metals from E-waste
- Danat Yermakovich - Investigating the functional relevance of Denisovan introgressed DNA among New Guineans
- Kanwal Batool - Coding variant analysis based on 5,492 ICD-10-based disease phenotypes in the Estonian Biobank
Lisaks nooremteadurite ja teadlaste ettekannetele olid taas kavas külalisettekanded. Oma teadustööst olid kutsutud rääkima valdkonna eksperdid Eestist ja välismaalt.
Mitmetele külalisesinejatele andis konverents võimaluse oma koduinstituuti naaseda Tartu Ülikooli vilistlasena ja rääkida oma kogemustest tänastele üliõpilastele.
Molekulaarse taimefüsioloogia kaasprofessor Hanna Hõrak (Tartu Ülikooli tehnoloogiainstituut)
- Ettekanne: „Stomatal distribution between leaf surfaces and its relationships with yield“
Gaasfermentatsiooni professor Kaspar Valgepea (Tartu Ülikooli bioinseneeria instituut)
- Ettekanne: „Capturing waste carbon using gas fermentation“
Bioloogiliste ravimite spetsialist Helerin Eiche (Ravimiamet)
- Ettekanne: „When biology becomes Medicine - an introduction to biological medicinal products“
Nanordica Medical ärijuht Meelis Kadaja (Nanordica Medical)
- Ettekanne: „My journey from scientist to entrepreneur: life outside the lab“
Geenitehnoloogia ja biomeditsiini osakonna kaasprofessor tenuuris Ott Scheler (Tallinna Tehnikaülikool)
- Ettekanne: „Droplet microfluidics for microbiology and biotechnology“
Rennes'i Ülikooli järeldoktor Antti Matvere (Rennes'i Ülikool)
- Ettekanne: „MCT1 causes resistance to SMAD3 inhibition in cancer and involves dysregulation of the cholesterol synthesis pathway“
Nanordica Medicali ärijuht Meelis Kadaja keskendus mõtteviisi muutusele teekonnal teadlasest ettevõtjaks. Insener ja teadlane mõtlevad erinevalt – insener töötab lõpp-produktini jõudmiseks välja vahendid, teadlane esitab aga rea küsimusi ja püüab püstitatud hüpoteesile vastata.
Oma ettekande teises pooles andis Meelis ülevaate haavahooldustoodete välja töötamisest krooniliste haavanditega patsientidele, millega Nanordicaga tegeleb.
Teadlase jaoks kõige olulisemad omadused on tööks vajalikud oskused, siiras huvi ja vastupidavus.
Helerin Eiche, Ravimiameti bioloogiliste ravimite kvaliteedihindaja andis ülevaate sellest, mida kujutavad endast bioloogilised ravimid ja kuidas nad Euroopa Liidus turule jõuavad.
Bioloogilised ravimid on võrreldes keemilise ravimiga nagu näiteks aspiriin väga keerulise molekulaarse ülesehitusega.
Neist enamik on täna kasvajate ja autoimmuunhaiguste ravis kasutatavad monoklonaalsed antikehad. Turul on bioloogiliste ravimitena ka rekombinantsed proteiinid, vaktsiinid, rakuteraapia ja geeniteraapiad ravimid, kuid viimaseid meil vaid paar tükki.
Hanna Hõrak, tehnoloogiainstituudi molekulaarse taimefüsioloogia kaasprofessor, kes sai hiljuti Euroopa Teadusnõukogu väljakujunenud teadlase grandi, tutvustas oma ettekandes, miks kliima soojenemise ja kuivuse kontekstis on oluline uurida taimede õhulõhesid.
Õhulõhed on väiksed avad lehe pinnal, nii selle alumisel kui ülemisel küljel, mis võimaldavad süsihappegaasi omastamist ja vee aurumist taimest. Õhulõhede mustrid ja õhulõhede avatus mõjutavad olulisel määral taimede kasvu, stressitaluvust ja saagikust.
Tuleviku põllumajanduse kontekstis on oluline arendada selliseid taimesorte, mis saavad hakkama küllaltki äärmuslikes oludes ja annavad ka saaki.
Konverentsi teise päeva lõpus kuulutas kahe instituudi teadlastest moodustunud žürii välja parimad ettekanded ja toimus auhindade pidulik üleandmine. Parima suulise ettekande pidas geneetika nooremteadur Lea Ets ("Adaptive evolution of Pseudomonas putida in the presence of fluoride exposed moonlighting transporter functions"). Auhinna parima stendiettekande eest sai funktsionaalse genoomika nooremteadur Kanwal Batool ("Coding variant analysis based on 5,492 ICD-10-based disease phenotypes in the Estonian Biobank").
Suuliste ja posterettekannete üldine tase oli kõrge ning mitmed komisjoni liikmed tõid välja, et valikut oli raske teha. Auhindade nimel käis tihe rebimine.
Hindamiskomisjoni kuulusid Mariliis Klaas, Silja Kuusk, Age Brauer, Tambet Tõnissoo, Ants Kurg, Signe Värv, Toomas Haller, Tarmo Annilo, Mart Kals, Lehti Saag ja Michael Dannemann.
Mikrobioloogia eriauhinnad pani välja Eesti Mikrobioloogide Ühendus (EMÜ). Neist ühe pälvis Tartu Ülikool bioinformaatika nooremteadur Liina Kuus ja teise juba kogenud doktoriõppe üliõpilane, geneetika nooremteadur Johanna Hendrikson.
Hindamiskomisjoni sõnul näitas Liina Kuus esimese aasta doktorandina suurt potentsiaali, kuna ta on koostöös piimatööstusega analüüsinud mikrobioloogilisi proove ja leidnud selle pinnalt olulisi tulemusi. Liina valdas teemat väga hästi ja tema töö annab vajalikku teavet tööstusele, et protsesse mikrobioloogiliselt ohutumaks muuta
Mikrobioloogiaga seotud ettekandeid, sh postreid, oli kokku 18, mis on tervelt 38% konverentsile esitatud teesidest.
Jonanna Hendrikson on neljanda aasta doktorant, kelle töö keskmeks on selgitada Pseudumonas putida biofilmi moodustumise mehhanisme ja sellega seotud faktorite regulatsiooni. Komisjon hindas kõrgelt Johanna motivatsiooni keerkate süsteemide lahtimõtestamisel ja järjepdevat arengut.
EMÜ auhinna komisjoni kuulusid Kertu Liis Krigul, Anne Menert, Signe Viggor ja Triinu Visnapuu.
Image
| Image
| Image
|
|---|
Tartu Ülikooli ettevõtlus- ja innovatsioonikeskus (EIK) koostöös instituutidega pani välja kaks auhinda „Mõte, mis viib tegudele“, millega tunnustati innovatsiooni rakenduspotentsiaaliga doktoriprojekte. Auhinna pälvisid Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi teadmussiirdedoktorant Astrid Laidna, kes rääkis haruldaste muldmetallide biolaugutamisest fosfokipsist ning genoomika instituudi genoomika nooremteadur Galadriel Lucia Velázquez Silva, kes esitles tööd reumatoidartriidist.
Auhinnad andsid üle instituutide ettevõtlusagendid Kristjan Välk ja Elina Aleksejeva-Zagura.
Image
| Image
|
|---|
Aastakonverensi korraldamist toetas projekt „Ülikoolide koostöö doktoriõppe edendamisel“ (2021-2027.4.04.24-0003), mida kaasrahastab Euroopa Liit.
Aastakonverentsi korraldas molekulaar- ja rakubioloogia instituudi rakubioloogia õppetool.
Täname: Arnold Kristjuhan, Lilian Kadaja-Saarepuu, Signe Värv, Dmitri Lubenets, Indrek Teino, Henel Jürgens, Mariliis Klaas, Toivo Maimets, Kalle Nemvalts ja Annika Trei.
Loe veel sarnaseid uudiseid
