Kaitstud doktoritööd

Siit lehelt leiad kaitstud doktoritööd alates instituudi loomisest. Esimene doktoritöö kaitsti meie instituudi nõukogus aastal 1991. 
Hetkel ei ole siia jõutud veel kõiki töid vanalt kodulehelt ümber tõsta, kuid töö selles osas käib. 


Uuemad tööd on leitavad ka ülikooli raamatukogu digitaalsest repositrooriumist DSpace (otsing näiteks autori nime alusel).

File

13. mail 2022 kell 14.15 kaitses Kreete Lüll oma doktoritööd „Investigating the relationships between human microbiome, host factors and female health“ („Inimese mikrobioomi mõjutavad faktorid ning seosed naiste tervisega“). 

Juhendaja:
kaasprofessor Elin Org, Tartu Ülikool

Oponent:
dr Anne Salonen, Helsingi Ülikool, Soome

Kokkuvõte
Viimastel aastatel on inimese mikrobioomi ja tervise vaheliste seoste uurimine olnud väga aktuaalseks teemaks teaduses. Mikrobioomi olulisus väljendub nii ainevahetusprotsesside, kui ka närvi- ja immuunsüsteemi töös ning toimimises. Mikrobioomi ennast mõjutavad mitmed erinevad faktorid, mille alla kuuluvad muuhulgas vanus, toitumine, ravimite tarbimine ja füüsiline aktiivsus. Geneetika mõju meie tervisele ning selle roll erinevate haiguste juures on uuritud pikalt, kuid samas on mikrobioomi ning inimesegeneetika vaheliste seoste uurimine alles algusjärgus.

Õppekava:
geenitehnoloogia

Eriala:
geenitehnoloogia

DSpace

20. juunil 2022 kl 16.00 kaitses Ludovica Molinaro oma doktoritööd „Ancestry deconvolution of Estonian, European and Worldwide genomic layers: a human population genomics excavation“ („Eesti, Euroopa ja üleilmsete inimgenoomide geneetilise päritolu kihtide lahtikaevamine“).

Õppekava:
geenitehnoloogia

Eriala:
geenitehnoloogia

Juhendajad:
Luca Pagani, Tartu Ülikool
Francesco Montinaro, Tartu Ülikool
Mait Metspalu, Tartu Ülikool

Oponent:
dr. Priya Moorjani, California Ülikool (USA)

DSpace

Kokkuvõte
Tänapäeval eeldame sageli, et meie moodne eluviis on minevikust parem, ja et mida kaugemale me ajas tagasi läheme, seda enam heitlesid mineviku inimesed kehvade elutingimuste või küündimatu tehnoloogiaga. Pole üllatav, et ajaloolised ja arheoloogilised uuringud äratavad meist paljude uudishimu – nende tõttu oleme sunnitud oma tänapäevast uskumuste süsteemi ümber kujundama ning jahmuma sellest, kui palju mineviku populatsioonid tegelikult saavutada suutsid. Mineviku inimesed olid organiseerunud ühiskonnaks, nad liikusid, rändasid, jagasid ideid, kultuure ja tehnoloogiaid – ja me leiame ikka veel nende kokkupuudete jälgi. Käesoleva doktoritöö eesmärgiks mineviku kokkupuudete jälgede uurimine geneetilistes andmetes.

Populatsioonide kokkupuudet nimetatakse segunemissündmuseks, mis tekitab segunenud populatsioone. Lähenemisviisiga, mida nimetatakse põlvnemise lahtiharutamiseks (Ancestry Deconvolution, AD), saame segunenud grupi geneetilist mosaiiki analüüsida, ajades segunemise osaliste jälgi, ja segunemissündmust täpsemalt iseloomustada.

AD lähenemisviiside seas on meetodid, mida nimetatakse lokaalse põlvnemise tuletamiseks (Local Ancestry Inferences, LAI), mis võimaldavad tuletada antud päriliku lookuse põlvnemist. Sellistel kõrge lahutusastmega tuletustel on piirangud, mis mõnel juhul LAI tööriistade jõudlust tugevalt piiravad. Seega, rakendades LA-d segunenud populatsioonil, mida iseloomustab põlvnemine eri maailmajagudest, saame keskenduda tundmatute mineviku demograafiliste sündmuste avastamisele, kuid LA kasutamine maailmajao sisestel segunemistel, näiteks Euroopa populatsioonidel, nõuab metodoloogilist lähenemist, mis on kujundatud nii, et see võtab kõigepealt arvesse LA piiranguid.

Lõpuks saame kasutada AD ja LAI lähenemisviise, et esitada küsimusi väljaspool demograafilisi uuringuid. Teatud fenotüübi väljakujunemise tõenäosust on võimalik osaliselt ennustada polügeensete skooride (Polygenic Scores, PS) abil. Kuid genoomile mõjuv tohutuhulk muutujaid on populatsioonispetsiifilised ja tuletused pole eriti ühelt populatsioonilt teisele üle kantavad, mis takistab PS-i rakendatavust vähem uuritud või segunenud populatsioonidele.

Esitletakse kolme uuringut, mis arutlevad AD ja LAI võimaluste ja piirangute üle. Uuritakse segunemissündmust, milles said kokku väga erinevad populatsioonid eri maailmajagudest; väikesel skaalal segunemissündmuste, näiteks Euroopa rühmade puhul, lahtiharutamise piiranguid; ja lõpuks rakendatakse kogutud teadmisi, ületamaks polügeensete skooride kasutamise piiranguid segunenud populatsioonidel.

DSpace

26. augustil 2022 kell 14.15 kaitses Tina Saupe oma doktoritööd „The genetic history of the Mediterranean before the common era: a focus on the Italian Peninsula“ („Vahemere piirkonna geneetiline kujunemine enne meie ajaarvamist: fookusega Apenniini poolsaarele”).

Õppekava:
geenitehnoloogia

Eriala:
geenitehnoloogia

Juhendajad:
kaasprofessor Christiana Lyn Scheib, Tartu Ülikool
professor Mait Metspalu, Tartu Ülikool
kaasprofessor Toomas Kivisild, Tartu Ülikool
külalisprofessor Luca Pagani, Tartu Ülikool

Oponent:
dr. Carina Schlebusch, Uppsala Ülikool (Rootsi)

DSpace

Kokkuvõte
Rohkearvulised ja erisugused uuringud on panustanud meie arusaamisesse inimajaloost. Inimasustuse ajalugu Euroopas sisaldab mitmeid etappe, sealhulgas küttide-korilaste Lääne-Euraasias elamine paleoliitikumis, põlluharimise ja karjakasvatuse kasutuselevõtt läbi kontaktide Levantist ja Anatooliast (Lääne-Aasia) Euroopasse rännanud inimestega ja Ponto-Kaspia stepirahvaste migratsioon. Enamik senistest uuringutest on keskendunud üldistele geneetilistele muutustele Euroopas ja nende seostele arheoloogiliste tõendite ja ajalooliste sündmustega. Sellegi poolest on mõned Euroopa piirkonnad jätkuvalt väheuuritud ja neile keskendumine võib aidata täita lünki inimeste rändeajaloos. See doktoritöö keskendub geneetilise ja sotsiaalse struktuuriga seotud muutustele Apenniini poolsaarel viimase jääaja maksimumi lõpust Rooma vabariigi loomiseni umbes 2000 aastat tagasi. Uuringu tarbeks genereeriti ülegenoomsed andmed inimsäilmetest, mis pärinesid mitmetest arheoloogilistest leiukohtadest. Neid andmeid analüüsiti varem avaldatud Euraasia ülegenoomsete andmete kontekstis, et uurida ammuste populatsioonide geneetilist ülesehitust ja selle muutusi läbi aja. Lõplik andmestik koosneb Euraasia indiviididest, kes pärinevad paleoliitikumist (43–5 tuhat aastat enne meie aega) rauaajani (1100–700 aastat enne meie aega). Tulemused näitavad, et Apenniini poolsaart on mõjutanud järjestikused migratsioonid, mis peegelduvad tänapäeva itaallaste geenitiigis ja on jätnud jälje kultuuri. Täpsemalt saabus eneoliitikumi-pronksiaja üleminekul stepist pärit inimestega uus geneetiline komponent ning matmiskombestikus toimunud muutused viitavad muudatustele ka sotsiaalses struktuuris. Rauaajal võib Apenniini poolsaare kaguosas näha erinevaid päritolumustreid, millest nähtub suur geneetiline varieeruvus.

 

Kaitsmist sai jälgida ka videosilla (Zoom) vahendusel.

7. septembril 2022 kell 13.45 kaitses Katri Pärna oma doktoritööd „Improving the personalized prediction of complex traits and diseases: application to type 2 diabetes“ („Komplekstunnuste ja -haiguste personaalse ennetamise edendamine teist tüüpi diabeedi näitel“).

Õppekava:
geenitehnoloogia 

Eriala:
geenitehnoloogia 

Juhendajad:
professor Luca Pagani, Tartu Ülikool ja Padova Ülikool (Itaalia)
teadur Davide Marnetto, Torino Ülikool (Itaalia)
professor Harold Snieder, Groningeni Ülikool (Holland)
vanemteadur Ilja M. Nolte, Groningeni Ülikool (Holland)
professor Krista Fischer, Tartu Ülikool
professor Reedik Mägi, Tartu Ülikool

Oponent:
dr Ryan Daniel Hernandez, California Ülikool (Ameerika Ühendriigid)

DSpace

Kokkuvõte
Tänapäeva maailmas on komplekshaigused üheks juhtivaks haigestumuse ja suremuse põhjuseks. Komplekshaigused tekivad mitmete geneetiliste ja mitte-geneetiliste (nt elustiili ja keskkonna) riskitegurite ning nendevaheliste keerukate koosmõjude tulemusel. Kuna need haigused põhjustavad terviseprobleeme ja on liigselt koormavad tervishoiusüsteemidele, siis otsivad teadlased lahendusi, kuidas neid haigusi avastada veel enne nende väljakujunemist. On teada, et erinevused geneetiliste komponentide ja elustiili osas põhjustavad haigusriski varieerumist inimeste vahel, mistõttu üheks lahenduseks selliste keerukate haiguste ennetamisel peetakse personaalset lähenemist, mis inimese geneetilise ja mitte-geneetilise info põhjal ennustaks tema haigusriski. Käesolevas väitekirjas käsitleti komplekshaigusena teist tüüpi diabeeti (T2D), mis tekib kõrge veresuhkru taseme korral ning põhjustab õigeaegse ja korrektse ravi puudumisel tüsistusi. T2D teadaolevateks riskiteguriteks on kõrgem vanus, madal kehaline aktiivsus, liigne kaloraaž, madal sotsiaalmajanduslik staatus, suitsetamine ja alkoholi tarvitamine. Geneetilisi riskitegureid ja nende seoseid elustiili ning keskkondlike riskiteguritega on küll uuritud, aga haiguse keerukuse tõttu pole täpseid toimemehhanisme veel välja selgitatud. Seetõttu uuriti käesolevas väitekirjas inimese genoomi, et mõista, kuidas paremini kasutada geneetilist informatsiooni T2D riski prognoosimiseks. Selleks kasutati polügeenset riskiskoori (PRS), mis summeerib inimese haiguse tekke geneetilise riski ja mille abil tuvastatakse juba praegu kõrgesse T2D riskirühma kuuluvaid indiviide. Siiski on veel mitmeid vastakaid seisukohti praeguseks väljatöötatud PRS-ide geneetilise riski hindamises. Näiteks ei pruugi PRS-i ennustustäpsus olla piisav või seda ei ole võimalik arvutada iga indiviidi jaoks sarnaselt, kuna iga genoom on mõjutatud suure hulga riskitegurite poolt, mis võivad erinevates populatsioonides erineda. Käesoleva väitekirja teadusartiklitel põhinevad viis peatükki keskendusid personaliseeritud T2D ennetuse parendamisele geneetiliste meetodite kaudu, PRS-i metoodiliste piirangute käsitlemisele ning epigeneetiliste riskitegurite rolli uurimisele T2D korral. Esimeses peatükis valideeriti kahes suures Euroopa biopangas PRS-meetodina topeltkaalutud geneetiline riskiskoor. Teises peatükis töötati välja uued PRS-meetodid, et parandada PRS-i ülekantavust neile indiviididele, kelle esivanemad pärinevad erinevatest populatsioonidest, kelle genoomid olid segunenud ja keda oli tänu uudsete geneetiliste meetodite kasutamisele võimalik uurida. Kolmandas peatükis uuriti PRS-i ülekantavust kahe Euroopa populatsiooni vahel, kus genoomid võivad erineda mitmete populatsioonispetsiifiliste tegurite tõttu. Neljandas peatükis testiti metülatsiooniskooride (MS) seost T2D ja selle glükeemiliste endofenotüüpidega, et teha kindlaks, kas epigeneetilised mehhanismid vahendavad keskkonna ja geeni-keskkonna koosmõjusid T2D tekkes. Viiendas peatükis anti ülevaade genoomika valdkonna viimastest arengutest ning nende rakendamise võimalustest personaalmeditsiinis just Eesti Geenivaramu näitel. Töö tulemused näitasid, et topeltkaalutud GRS töötas paremini kui traditsiooniline GRS. Uued PRS-id, mis kasutasid geneetilise lookuse kindlast populatsioonist põlvnemise hindamise meetodit, parandasid komplekstunnuste prognoosimise täpsust hiljuti segunenud indiviidide puhul, kes varasemalt jäeti geneetilistest uuringutest välja, kuid uudse PRS meetodi tõttu on võimalik neid nüüd kaasata personaalmeditsiini uuringutesse. Uudne populatsioonistruktuuri korrigeerimisviis geneetilistes analüüsides ei parandanud PRS ülekantavust kahe Euroopa kohordi vahel ja isegi traditsioonilise lähenemisviisiga saadud PRS sisaldas populatsioonistruktuuri. MS-id näitasid, et epigeneetika on võimalik molekulaarne vahelüli, mis peegeldab keskkonna ja elustiili mõju T2D-le ja selle endofenotüüpidele. Töö tulemused näitavad komplekstunnuste ja -haiguste personaalse ennetuse täpsema ja laialdasema rakenduse võimalikkust, mis viib meid sammu lähemale personaalmeditsiinile eesmärgiga pikendada inimeste tervena elatud aastate arvu.

Kaitsmine toimus Groningeni Ülikooli aulas (Broerstraat 5, Groningen, Holland) kell 12.45 (Hollandi aeg). Veebilink: www.rug.nl/digitalphd.

Välja anti ühiskraad kahe ülikooli poolt.

9. septembril 2022 kell 12.15 kaitses Nele Taba oma doktoritööd „Diet, blood metabolites, and health“ („Toitumine, vere metaboliidid ja tervis“).

Juhendajad:
professor Krista Fischer, Tartu Ülikool
professor Tõnu Esko, Tartu Ülikool
Nicola Pirastu, Edinburghi Ülikool (Ühendkuningriik)
professor Andres Metspalu, Tartu Ülikool

Oponent:
professor Hannelore Daniel, Müncheni Tehnikaülikool (Saksamaa)

Õppekava:
molekulaar- ja rakubioloogia 

Eriala:
molekulaarne biomeditsiin

DSpace

Kokkuvõte 

Täpsem arusaam, kuidas ja mille kaudu toitumine tervist mõjutab, loob soodsa pinnase tervist edendavatele personaliseeritud toitumissoovitustele. Üks võimalus toitumise ja tervise vaheliste seoste selgitamiseks on uurida veres ringlevate metaboliitide tasemeid, kuna need on mõjutatud toitumisest ning on omakorda erinevate haiguste ennustajateks. Käesoleva doktoritöö eesmärgiks on anda vere metaboliitide uurimise kaudu lisateadmisi selle kohta, kuidas toitumine mõjutab tervist. Esmalt kasutasime Mendeli Randomiseerimise (MR) meetodit, et tuvastada, milline on toitumisvalikute potentsiaalselt põhjuslik mõju vere metaboliitidele. Kuna leitud tulemused ühtisid varasemate randomiseeritud uuringutega ning olid osalt vastuolus vaatlusuuringutega, tõestasime et MR on sobiv ja kasulik meetod toitumise mõju uurimiseks. Kokku leidsime 413 potentsiaalselt põhjuslikku seost. Muuhulgas viitavad tulemused, et nii kohvi kui ka alkohoolsete jookide suurem tarbimine tõstab madala ja keskmise tihedusega lipoproteiinidega seotud metaboliitide tasemeid, samas kui väga madala tihedusega lipoproteiinidega seotud metaboliitide tasemetele tundub mõju olevat vaid suuremal kohvi tarbimisel, aga mitte alkoholi tarbimisel. Teiseks vaatlesime toidu neofoobia (FN) ja vere metaboliitide vahelisi seoseid ning leidsime, et kõrgem tulemus FN skaalal seostub madalamate omega-3 rasvhapetega seotud mõõtmistega. Lisaks, FN mõju tüüp 2 diabeedile ja südameveresoonkonna haigustele vajab kinnitust tulevaste uuringute poolt, kuna mõlema haiguse osas oli FN riski tõstev mõju väljendunud vaid ühes vaadeldud kahest kohordist. Kolmandaks uurisime, kas vere metaboliitide profiil kirjeldab inimese bioloogilist vanust (BA) ning kas erinevus sellise BA ja kronoloogilise vanuse vahel ennustab tervisenäitajaid. Leidsime, et metaboliitide-põhine BA võib olla populatsiooni-spetsiifiline ning seostub kardiovaskulaarsete riskifaktoritega. Lisaks viitavad meie tulemused sellele, et metaboliitide-põhine BA võib olla seotud toitumiskäitumisega. Kokkuvõttes annavad leitud tulemused uusi teadmisi toitumise, metaboliitide ja tervise omavaheliste seoste kohta ning on seega aluseks tulevastele randomiseeritud uuringutele mis loovad omakorda pinnase teadlikele tervist edendavatele personaliseeritud toitumissoovitustele.

16. septembril 2022 kell 10.15 kaitses Silva Lilleorg oma doktoritööd „Bacterial ribosome heterogeneity on the example of bL31 paralogs in Escherichia coli“ („Ribosoomide heterogeensus bakterites Escherichia coli bL31 paraloogide näitel“).

Juhendaja:
kaasprofessor Aivar Liiv, Tartu Ülikool

Oponent:
professor Isabella Moll, Viini Ülikool (Austria)

Õppekava:
molekulaar- ja rakubioloogia

Eriala:
molekulaarbioloogia 

DSpace


Kokkuvõte
Selleks, et ellu jääda, kasvada ja paljuneda, vajavad organismid sadu erinevaid valke, mis toimivad struktuursete komponentide, ensüümide, signaalivahendajate, transpordi- ja säilitusmolekulidena. Lisaks sellele on elutähtis, et valgud oleksid funktsionaalsed sobivas koguses, õigel ajal ja vajalikus kohas – seetõttu on valgusüntees ja selle regulatsioon kesksemaid eluprotsesse. Kõiki valke sünteesivad ribosoomid, RNA-st ja valkudest koosnevad kompleksid. Bakteri ribosoom, selle doktoritöö uurimisobjekt, koosneb kolmest ribosoomi RNAst ja rohkem kui 50 ribosoomi valgust, mis jagunevad kahe subühiku vahel. Eksperimentaalselt on kindlaks tehtud, et nii päris- kui eeltuumsed organismid sisaldavad mõnevõrra erineva ülesehitusega ribosoome. Samas ei ole selle nähtuse – ribosoomide heterogeensuse – bioloogiline tähtsus teada. Käesoleva doktoritöö fookuses on soolekepikese (E. coli) teatud tüüpi ribosoomi valgud (paraloogid), millel on ühine eellane, kuid mis kodeerivad erinevaid valke. Küsimus on, kas E. coli ribosoomid on paraloogide poolest heterogeensed. Mis võiks olla sellise molekulaarse mitmekesisuse roll valgusünteesil ja bakterite kasvu jaoks? E. coli ribosoomide valgulise koostise analüüs tuvastas, et nii kiire kasvu korral kui statsionaarses kasvufaasis esinevad samaaegselt ribosoomi valkude paraloogide poolest heterogeensed ribosoomid. Kasvukatsed näitasid, et ribosoomi valk bL31 paraloogid (bL31A ja bL31B) on olulised, ent mitte samaväärsed bakterite kasvuks madalamatel temperatuuridel. Nimelt annab bL31A olemasolu bakterirakkudele kiire kasvu faasis kasvueelise võrreldes bL31B-ga. bL31A ja bL31B osalevad üksteisega samaväärselt optimaalse translatsiooni initsiatsiooni etapi kiiruse ja ribosoomi subühikute ühendamise tagamisel. Samas näitavad meie tulemused, et võrreldes bL31B-d sisaldavate ribosoomidega on bL31A-d sisaldavad ribosoomid protsessiivsemad ja teevad vähem vigu valgusünteesi käigus. Doktoritöö tulemused avardavad oluliselt teadmisi ribosoomide heterogeensusest bakterites ning ribosoomi valgu bL31 tähtsusest valgusünteesil.

Aeg ja koht: Teisipäeval, 30. märtsil 2021 kell 12.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktortöö teema: „Arüülsüsivesinike retseptori uurimine hiire munasarja granuloosarakkudes ja inimese embrüonaalsetes tüvirakkudes" ("Studies on aryl hydrocarbon receptor in murine granuIosa cells and human embryonic stem cells")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia doktoriõppekava
Eriala: rakubioloogia

Töö DSpace'is

Juhendajad: TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi rakubioloogia professor Toivo Maimets ja epigeneetika professor Arnold Kristjuhan

Oponent: professor Xavier Coumoul, University Paris Descartes, Prantsusmaa

 

Aeg ja koht: Teisipäeval, 15. juunil 2021 kell 14.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktortöö teema: „Induse jõe oru inimeste, parside, India juutide ja Tharu hõimu geneetilise põlvnemise piiritlemine" ("Delineating genetic ancestries of people of the Indus Valley, Parsis, Indian Jews and Tharu tribe")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia doktoriõppekava
Eriala: molekulaarbioloogia

Töö DSpace'is

Juhendajad:  TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi populatsioonigeneetika professor Richard Villems ja Banaras Hindu ülikooli professor Gyaneshwer Chaubey

Oponent: professor Francesc Calafell, Pompeu Farba ülikool (Barcelona), Hispaania

Aeg ja koht: Teisipäeval, 24. augustil kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktortöö teema: „Iidsete Euraasia mõjude iseloomustamine tänapäeva inimgenoomides" ("Characterization of ancient Eurasian influences within modern human genomes")
Õppekava: geenitehnoloogia doktoriõppekava
Eriala: geenitehnoloogia

Töö DSpace'is

Juhendajad: TÜ GI külalisprofessor Luca Pagani, GI evolutsioonilise genoomika professor Mait Metspalu ja GI populatsioonigeneetika kaasprofessor Toomas Kivisild

Oponent: Dr Mehmet Somel, Associate Professor in Human Evolutionary Genetics at the Middle East Technical University of Ankara, Türgi

Aeg ja koht: Kolmapäeval, 25. augustil kell 11.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktortöö teema: „Taimede DNA tuvastamine metagenoomsetest proovidest" ("The identification of plant DNA in metagenomic samples")
Õppekava: geenitehnoloogia doktoriõppekava
Eriala: geenitehnoloogia

Töö DSpace'is

Juhendaja: TÜ professor Maido Remm

Oponent: Filipe Pereira, PhD (Coimbra Ülikool, Portugal)

Aeg ja koht: Teisipäeval, 31. augustil kell 11.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktortöö teema: „Ameerika populatsioonide genoomne portree" ("A genomic portrait of American populations")
Õppekava: geenitehnoloogia doktoriõppekava
Eriala: geenitehnoloogia

Töö DSpace'is

Juhendajad: TÜ GI moodsa populatsioonigeneetika teadur Francesco Montinaro, TÜ GI külalisprofessor Luca Pagani,  TÜ GI evolutsioonilise genoomika professor Mait Metspalu

Oponent: Dr Cesar Fortes Lima, Uppsala Ülikool, Rootsi

Aeg ja koht: esmaspäev, 29. juuni 2020.a. kell 11.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema:
"Understanding the mechanisms of endometrial receptivity through integration of 'omics' data layers"
(Geeniekspressiooni andmete integreerimine teiste 'oomika' andmetega kirjeldamaks endomeetriumi retseptiivsuse mehhanisme)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Info DSpace'is
Juhendajad: TÜ genoomika instituudi juhtivteadur Reedik Mägi, TÜ genoomika instituudi juhtivteadur ning molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Andres Metspalu, TÜ kliinilise meditsiini instituudi professor Andres Salumets
Oponent: Dr Stephan Beck (PhD FMedSci, Professor of Medical Genomics, UCL Cancer Institute University College London, Suurbritannia)

 

Aeg ja koht: kolmapäev, 26. august 2020. a. kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema: "Overview of the phylogeny and phylogeography of the Y-chromosomal haplogroup N in northern Eurasia and case studies of two linguistically exceptional populations of Europe - Hungarians and Kalmyks''
(,,Ülevaade Põhja_Euraasias laialt levinud Y_kromosoomaalse haplogrupi N fülogeneesist ja fülogeograafiast ning Euroopa kahe keeleliselt erandliku rahva - ungarlaste ja kalmõkkide - populatsiooniuuringud")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Töö DSpace'is
Juhendajad: TÜ genoomika instituudi vanemteadur Siiri Rootsi ning molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor ja genoomika instituudi juhtivteadur Richard Villems
Oponent: professor Maarten Larmuseaud, lnimese Geneetika osakond, Leuveni Ülikool, Belgia

Aeg ja koht: neljapäev, 27. august 2020. a. kell 11.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema: "Exploring the genetics of adverse events in pharmacotherapy using Biobanks and Electronic Health Records"
(,,Farmakoteraapias esinevate kõrvaltoimete geneetika uurimine biopankade ja elektrooniliste terviseandmete põhjal")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Töö DSpace'is
Juhendajad: TÜ genoomika instituudi juhtivteadur Lili Milani ning molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor ja genoomika instituudi juhtivteadur Andres Metspalu
Oponent: professor Sir Munir Pirmohamed, Liverpooli Kuninglik Ülikool, Suurbritannia

Aeg ja koht: reede, 4. september 2020. a. kell 11.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema: "Mutagenic effect of transcription and transcription-coupled repair factors in Pseudomonas putida"
(,,Transkriptsiooni ja transkriptsiooniseoselist reparatsiooni vahendavate faktorite mutageenne mõju bakteris Pseudomonas putida")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Töö DSpace'is
Juhendaja: professor Maia Kivisaar, molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: professor Elzbieta Kraszewska, Biokeemia ja Biofüüsika Instituut, Varssav, Poola

Aeg ja koht: reede, 18. september 2020. a. kell 14.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema: "Signals and responses of ColRS two-component system in Pseudomonas putida''
("ColRS süsteemi aktiveeriv signaal ning selle süsteemi roll Pseudomonas putida stressitaluvuses")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Töö DSpace'is
Juhendaja: TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi geneetika vanemteadur Rita Hõrak
Oponent: professor Thorsten Mascher, Chair of General Microbiology, lnstitute of Microbiology, Technische Universität Dresden

Aeg ja koht: esmaspäev, 5. oktoober 2020 kell 15.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti Biokeskuse auditoorium) ja videosillas
Doktoritöö teema: "Studies on aryl hydrocarbon receptor in the mouse granulosa cell model" ("Arüülsüsivesinike retseptor hiire munasarja granuloosarakkudes")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Töö DSpace`is
Juhendaja: Tartu Ülikooli rakubioloogia professor Toivo Maimets, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: professor Jason Matthews, Oslo Ülikool, Norra

Aeg ja koht: teisipäev, 04. juuni 2019 kell 14:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Value of genomics for atherosclerotic cardiovascular disease risk prediction”
("Geeniinfo väärtus kardiovaskulaarhaiguste riski hindajana")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Töö DSpace'is
Juhendajad: Tartu Ülikooli genoomika instituudi Eesti geenivaramu juhataja, genoomika ja biopankade juhtivteadur ning molekulaar- ja rakubioloogia instituudi biotehnoloogia professor Andres Metspalu ning genoomika instituudi asedirektor ja populatsiooni- ja funktsionaalse genoomika vanemteadur Tõnu Esko
Oponent: rahva tervise ja geneetika professor Martina Cornel, PhD, M.D., Kliinilise Geneetika / Amsterdami Rahva Tervise Uurimise Instituut Amsterdam UMC (Clinical Genetics/Amsterdam Public Health research institute Amsterdam UMC), Amsterdam, Holland
 

Aeg ja koht: teisipäev, 27. august 2019 kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „The pleiotropic functions of ribosomal proteins eL19 and eL24 in the budding yeast ribosome”
(“Ribosoomi valkude eL19 ja eL24 funktsioonid pagaripärmi ribosoomis”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Töö DSpace'is
Juhendajad: professor Jaanus Remme ja vanemteadur Tiina Tamm, molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: professor Denis LJ Lafontaine, Molekulaarbioloogia ja Meditsiini Instituut, Brüsseli Vaba Ülikool, Belgia

Aeg ja koht: kolmapäev, 28. august 2019 kell 14.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „On the origin of papillomavirus proteins”
(“Papilloomiviirustes esinevate valkude päritolu”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Info DSpace'is
Juhendajad: vanemteadur Aare Abroi, tehnoloogiainstituut ja professor Maido Remm, molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: vanemteadur Andrew E. Firth, PhD, Patoloogia osakond, Cambridge’i Ülikool, Cambridge, Suurbritannia

Aeg ja koht: neljapäev, 12. september 2019. a. kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „The prehistory of Estonia from a genetic perspective: new insights from ancient DNA”
(“Eesti esiajalugu geneetika vaatevinklist: uus teave vana DNA uuringutest”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: TÜ genoomika instituudi direktor ja vanemteadur Mait Metspalu, TÜ genoomika instituudi vanemteadur Kristiina Tambets ning TÜ genoomika instituudi vanemteadur ja Leuven KU professor Toomas Kivisild
Oponent: geneetika professor Daniel Bradley, PhD, Trinity College Dublin, Dublini Ülikool, Iirimaa

Aeg ja koht: esmaspäev, 07. oktoober 2019. a. kell 14.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Meandering along the mtDNA phylogeny; causerie and digression about what it can tell us about human migrations”
(“Uidates mtDNA fülogeneesi radadel; essee väikeste kõrvalepõigetega sellest, mida see meile inimese migratsioonidest kõnelda võib”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Richard Villems ning TÜ genoomika instituudi direktor ja vanemteadur Mait Metspalu
Oponent: dotsent Rosa Fregel, PhD, Geneetika osakond, La Laguna Ülikool, Tenerife, Hispaania

Aeg ja koht: neljapäev, 17. oktoober 2019. a. kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Levansucrase Lsc3 and endo-levanase BT1760: characterization and application for the synthesis of novel prebiotics”
(“Levaansukraasi Lsc3 ja endo-levanaasi BT1760 iseloomustamine ja rakendatavus uudsete prebiootikumide tootmises")
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendaja: TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi geneetika dotsent Tiina Alamäe
Oponent: professor Ebru Toksoy Öner, PhD, Biotehnoloogia osakond, Inseneriteaduskond, Marmara Ülikool, Istanbul, Türgi

Aeg ja koht: teisipäev, 12. november 2019. a. kell 10.15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema:
Genetic history of the Uralic-speaking peoples as seen through the paternal haplogroup N and autosomal variation of northern Eurasians
(“Uurali rahvaste geneetiline ajalugu läbi isaliini N ja autosoomse varieeruvuse prisma")
Õppekava: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: TÜ genoomika instituudi vanemteadurid Kristiina Tambets ja Siiri Rootsi ning TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituudi arheogeneetika professor Richard Villems
Oponent: dotsent Beniamino Trombetta, PhD, Bioloogia ja biotehnoloogia osakond “C. Darwin”, Rooma Sapienza Ülikool, Itaalia

Aeg ja koht: teisipäev, 20. märts 2018 kell 14:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, auditoorium 105)
Doktoritöö teema: „Irc3 is a mitochondrial branch migration enzyme in Saccharomyces cerevisiae”
("Mitokondriaalne DNA hargnemisi mobiliseeriv ensüüm Irc3")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia 
Eriala: biokeemia
Info Dspace'is
Juhendajad: professor Juhan Sedman, teadur Tiina Sedman
Oponent: professor Cyril Mark Sanders, Sheffieldi Ülikool, Suurbritannia

Aeg ja koht: teisipäev, 22. mai 2018 kell 12:15 Tartu Ülikooli genoomika instituudis, auditooriumis Riia 23b/2-105
Doktoritöö teema: "Genome structural variation modulating the placenta and pregnancy maintenance"
("Genoomi struktuursed varieeruvused platsenta ja raseduse mõjutajatena")
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendaja: professor Maris Laan, bio- ja siirdemeditsiini instituut, Tartu Ülikool
Oponent: professor Julie C.Baker, Stanfordi Ülikool, Stanford, California, USA

Aeg ja koht: reede, 15. juuni 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli genoomika instituudis, auditooriumis Riia 23b/2-105
Doktoritöö teema: „Fis regulates Pseudomonas putida biofilm formation by controlling the expression of lapA”
(“Fis suurendab Pseudomonas putida biofilmi hulka, tõstes lapA ekspressiooni”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendaja: dotsent Riho Teras, molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Tartu Ülikool
Oponent: professor Fernando Govantes, Pablo de Olavide Ülikool, Sevilla, Hispaania

Aeg ja koht: neljapäev, 21. juuni 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli genoomika instituudis, auditooriumis Riia 23b/2-105
Doktoritöö teema: „The role of global regulator Fis in regulating the expression of lapF and the hydrophobicity of soil bacterium Pseudomonas putida”
(“Globaalse regulaatorvalgu Fis-i roll lapF geeni ekspressiooni reguleerimisel ja rakupinna hüdrofoobsuse mõjutamisel mullabakteris Pseudomonas putida”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Info DSpace'is
Juhendaja: dotsent Riho Teras, molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: juhtivteadur Carla C. C. R. de Carvalho, PhD,  Instituto Superior Técnico, Lissaboni Ülikool, Lissabon, Portugal

Aeg ja koht: reede, 22. juuni 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Genomic imprinting in complex traits” 
(“Geneetilise vermimise mõju komplekstunnustele”)
Info DSpace'is
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Juhendajad: Tartu Ülikooli genoomika instituudi bioinformaatika vanemteadur Reedik Mägi ning genoomika instituudi direktor ja molekulaar- ja rakubioloogia instituudi biotehnoloogia professor Andres Metspalu
Oponent: meditsiinigenoomika professor Stephan Beck, PhD, University College London, London, Suurbritannia

Aeg ja koht: kolmapäev, 29. august 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „K-mer based methods for the identification of bacteria and plasmids”
(“K-meeridel põhinevad meetodid bakterite ja plasmiidide tuvastamiseks”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Info DSpace'is
Juhendaja: Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Maido Remm
Oponent: professor Ole Lund, Bio- ja meditsiiniinformaatika osakond, Taani Tehnikaülikool, Lyngby, Taani

Aeg ja koht: reede, 21. september 2018 kell 12:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23-217)
Doktoritöö teema: „Role of translesion DNA polymerases in mutagenesis and DNA damage tolerance in Pseudomonads"
("Spetsialiseeritud DNA polümeraaside osalus mutageneesil ja DNA kahjustuste tolereerimisel pseudomonaadides")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Info DSpace'is
Juhendajad: Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Maia Kivisaar
Oponent: teadur, rühmajuht Vincent Pagès, PhD, Marseille Vähiuuringute Keskus (CRCM), Prantsusmaa

Aeg ja koht: reede, 28. september 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Utilization of α-glucosidic sugars by Ogataea (Hansenula) polymorpha”
(“α-glükosiidsete suhkrute kasutamine pärmil Ogataea (Hansenula) polymorpha”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: mikrobioloogia
Info DSpace'is
Juhendaja: Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi dotsent Tiina Alamäe
Oponent: dotsent Stefan Janecek, Molekulaarbioloogia Instituut, Slovakkia Teaduste Akadeemia, Bratislava, Slovakkia

Aeg ja koht: neljapäev, 15. november 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Physiological effects of the Pseudomonas putida toxin GraT”
(“Pseudomonas putida toksiini GraT mõju bakteri füsioloogiale”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Info DSpace'is
Juhendajad: Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudi geneetika vanemteadur Rita Hõrak ja molekulaarbioloogia professor Jaanus Remme
Oponent: dotsent Ditlev Egeskov Brodersen, PhD, Molekulaarbioloogia ja Geneetika osakond, Aarhusi Ülikool, Taani

Aeg ja koht: esmaspäev, 10. detsember 2018 kell 10:15 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (Riia 23b/2-105, Tartu Ülikooli genoomika instituudi auditoorium)
Doktoritöö teema: „Perspectives from human Y chromosome – phylogeny, population dynamics and founder events”
(“Vaade inimese Y kromosoomile – fülogenees, populatsiooni dünaamika ja asutajasündmused”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: Tartu Ülikooli genoomika instituudi vanemteadur ja direktor Mait Metspalu, genoomika instituudi vanemteadur Ene Metspalu, genoomika instituudi vanemteadur Siiri Rootsi, genoomika instituudi vanemteadur Toomas Kivisild
Oponent: professor ja vanemteadur Agnar Helgason, Islandi Ülikool, deCODE Genetics, Reykjavik, Island
 

Aeg ja koht: reede, 20.01.2017 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B/2 auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Comparative genome-wide DNA methylation studies of healthy human tissues and non-small cell lung cancer tissue”
(“Inimese tervete kudede ja mitteväikerakulise kopsuvähi võrdlevad ülegenoomsed DNA metülatsiooni uuringud”)
Info DSpace'is
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendajad: TÜ Eesti geenivaramu vanemteadurid Neeme Tõnisson ja Lili Azin Milani
Oponent: prof. Stephan Beck, University College London, Suurbritannia

Aeg ja koht: reede, 24. märts 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr. 105)
Doktoritöö teema: „Processivity of cellulases and chitinases” 
(“Tsellulaaside ja kitinaaside protsessiivsus”)
Info DSpace'is
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia 
Juhendaja: TÜ LTMR vanemteadur Priit Väljamäe
Oponent: dotsent Jerry Ståhlberg, Keemia ja Biotehnoloogia osakond, Rootsi Põllumajandusteaduste Ülikool (SLU), Uppsala, Rootsi

Aeg ja koht: reede, 21.aprill 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: „Scavenger receptors as a target for nucleic acid delivery with peptide vectors” 
(“Püüdurretseptorid kui peptiididega nukleiinhapete rakku transportimise sihtmärgid")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: LTMR professor ja LTTI vanemteadur Margus Pooga; LTMR teadur Kärt Padari
Oponent: professor Pirjo Laakkonen, arstiteaduskond, Helsingi Ülikool, Soome

Aeg ja koht: esmaspäev, 22. mai 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: "The Williams-Beuren syndrome chromosome region protein WBSCR22 is a ribosome biogenesis factor"
(“Williams-Beureni sündroomi kromosoomiregiooni valk WBSCR22 kui ribosoomi biogeneesifaktor")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: LTMR professor Ants Kurg ja LTTI vanemteadur Reet Kurg
Oponent: professor Pierre-Emmanuel Gleizes, Toulouse-Paul Sabatier'i Ülikool, Prantsusmaa

Aeg ja koht: reede, 9. juuni 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: „In-depth analysis of factors affecting variability in thiopurine methyltransferase activity”
(“Uute tiopuriinmetüültransferaasi aktiivsust mõjutavate biomarkerite otsingul”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Info DSpace'is
Juhendajad: LTMR professor ja Eesti Geenivaramu direktor Andres Metspalu, Eesti Geenivaramu vanemteadur Lili Milani
Oponent: professor Ingolf Paul Erich Cascorbi, Kieli Christian Albrechti Ülikool, Kiel, Saksamaa

Aeg ja koht: neljapäev, 22. juuni 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: "The role of RIC8A in the development and regulation of mouse nervous system”
(“RIC8A roll hiire närvisüsteemis ja selle arengus”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: arengubioloogia
Info DSpace'is
Juhendajad: LTMR professor ja LTTI vanemteadur Margus Pooga ja LTMR dotsent Tambet Tõnissoo
Oponent: professor David J. Price, Edinburgh Ülikool, Suurbritannia

Aeg ja koht: teisipäev, 22. august 2017 kell 14:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: „Genetic regulation of gene expression: detection of tissue- and cell type-specific effects”
(“Geeniekspressiooni geneetiline regulatsioon: koe- ja rakutüübi-spetsiifiliste efektide leidmine”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Info DSpace'is
Juhendajad: Eesti Geenivaramu farmakogenoomika vanemteadur Lili Milani, Eesti Geenivaramu biostatistika vanemteadur Krista Fischer ning TÜ MRI biotehnoloogia professor ja Eesti Geenivaramu direktor Andres Metspalu
Oponent: dotsent Tuuli Lappalainen, PhD, New Yorgi Genoomikakeskus, Süsteemibioloogia teaduskond, Columbia Ülikool, New York, USA

Aeg ja koht: kolmapäev, 20. september 2017 kell 12:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: "The acquisition of cellulose chain by a processive cellobiohydrolase"
("Tselluloosiahela sidumine protsessiivse tsellobiohüdrolaasi poolt"
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: biokeemia
Info DSpace'is
Juhendaja: vanemteadur Priit Väljamäe, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Tartu Ülikool
Oponent: dotsent Kiyohiko Igarashi, Metsakeemia laboratoorium, Biomaterjaliteaduse osakond, Tokyo Ülikool, Jaapan
 

Aeg ja koht: reede, 15. detsember 2017 kell 10:15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis (Riia 23B/2, Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema: „Dissecting the mechanism of enzymatic degradation of cellulose using low molecular weight model substrates”
("Tselluloosi ensümaatilise hüdrolüüsi mehhanismi uurimine madalmolekulaarsete mudelsubstraatide abil")
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Info DSpace'is
Juhendaja: vanemteadur Priit Väljamäe, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Tartu Ülikool
Oponent: dotsent ja uurija-professor Kristiina Kruus, PhD, Helsinki Ülikool, Helsinki; Tehnoloogia Uurimiskeskuses VTT OY, Espoo, Soome

Aeg ja koht: esmaspäev, 5.12.2016 kell 14.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Communicating genomic research results to population-based biobank participants”
(“Genoomsete teadustöötulemuste tagasiside populatsioonipõhise biopanga geenidoonoritele”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendajad: LTMR professor Andres Metspalu ja Singapuri Genoomi Instituudi töörühma juht dr Pauline Ng
Oponent: professor Helena Kääriäinen, Tervise ja Hoolekande Rahvuslik Instituut (National Institute for Health and Welfare), Helsingi, Soome
Info Dspace'is

Aeg ja koht: reede, 2.12.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Random walks in the stringent response”
(“Juhukõnnid translatsioonis ”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendajad: LTTI professor Tanel Tenson ja vanemteadur Vasili Hauryiliuk
Oponent: dr. Andrey L. Konevega, Ph.D., Molekulaar ja Radiatsiooni Biofüüsika osakonna juhataja, Peterburi Tuumafüüsika Instituut, Rahvuslik Uurimiskeskus „Kurchatov Institute“, Venemaa
Info DSpace'is
 

Aeg ja koht: teisipäev, 18.10.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "The GraTA toxin-antitoxin system of Pseudomonas putida: regulation and role in stress tolerance"
("Pseudomonas putida toksiin-antitoksiin süsteem GraTA: regulatsioon ja osalus stressitaluvuses")
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Juhendaja: LTMR vanemteadur Rita Hõrak
Oponent: Prof. Laurence van Melderen, Brüsseli Vaba Ülikool, Brüssel, Belgia
Info DSpace'is

Aeg ja koht: teisipäev, 13.09.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „RNA polymerase II-dependent transcription elongation in Saccharomyces cerevisiae
(“RNA polümeraas II-sõltuva transkriptsiooni elongatsioon pagaripärmis Saccharomyces cerevisiae”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendaja: LTMR professor Arnold Kristjuhan
Oponent: Prof. Ann Ehrenhofer-Murray, Berliini Humboldti Ülikool, Berliin, Saksamaa
Info DSpace'is

Aeg ja koht: teisipäev, 30.08.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Studies on cellular and molecular mechanisms that drive normal and regenerative processes in the liver and pathological processes in Dupuytren’s contracture”
(“Terve ja kahjustatud maksa regeneratsioonis ning Dupuytren´i kontraktuuri progressioonis osalevate rakuliste ja molekulaarsete mehhanismide uurimine”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendaja: LTMR vanemteadur Viljar Jaks
Oponent: Prof. Dr. Robert P. Coppes, PhD, UMCG, Groningeni Ülikool, Holland
Info DSpace'is

Aeg ja koht: reede, 26.08.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Studies on cell growth promoting AKT signaling pathway - a promising anti-cancer drug target“
(„Rakkude paljunemist soodustav AKT signaalirada kui potentsiaalne kasvajavastase ravi sihtmärk”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendaja: LTMR vanemteadur Viljar Jaks
Oponent: teadusdirektor Juha Tapio Klefström, PhD, Arstiteaduskond, Helsinki Ülikool, Soome
Info DSpace'is

Aeg ja koht: kolmapäev, 24.08.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „Translocation of cell-penetrating peptides across biological membranes and interactions with plasma membrane constituents“
(„Rakku sisenevate peptiidide membraani läbimise mehhanismid ja interaktsioonid plasmamembraani komponentidega”)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendajad: LTMR professor Margus Pooga
Oponent: direktor dr. Sandrine Sagan, PhD, Biomolekulide Laboratoorium, UMR7203 CNRS-ENS-UPMC, Pariis, Prantsusmaa
Info DSpace'is

Aeg ja koht: teisipäev, 23.08.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema:  „MicroRNAs in disease and health: aberrant regulation in lung cancer and association with genomic variation”
(“MikroRNAde roll haiguste kujunemisel: aberratsioonid kopsuvähis ning seosed genoomse varieeruvusega”)  
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendaja: Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu vanemteadur Tarmo Annilo
Oponent: vanemteadur Manlio Vinciguerra, PhD (ingl. Principal Research Associate), Institute for Liver & Digestive Health, University College London, London, Suurbritannia
Info DSpace'is
 

Aeg ja koht: esmaspäev, 22.08.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: „The role of RIC8A in mouse development and its function in cell-matrix adhesion and actin cytoskeletal organisation“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: arengubioloogia
Juhendajad: LTMR professor Margus Pooga ja LTMR teadur Tambet Tõnissoo
Oponent: teadusdirektor professor Pekka Lappalainen, PhD, Helsingi Ülikooli Biotehnoloogia Instituut, Helsingi, Soome
DSpace
 

Aeg ja koht: kolmapäev, 15.06.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: Characterization of cell-penetrating peptide/nucleic acid nanocomplexes and their cell-entry mechanisms
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendajad: LTMR professor Margus Pooga ja teadur Kärt Padari
Oponent: professor Ines Neundorf, Biokeemia Instituut, Keemia teaduskond, Kölni Ülikool, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht: esmaspäev, 23.05.2016 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema:  “Functions and regulation of the mammalian pseudokinase TRIB3”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia 
Juhendajad: LTMR professor Jaanus Remme ja Eesti Biokeskuse vanemteadur Tõnis Örd
Oponent: dotsent Guillermo Velasco Diez, Madridi Complutense Ülikool, Hispaania
DSpace

Aeg ja koht: reede, 16.01.2015 kell 14.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B  auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: “Genetics of adaptive traits and gender-specific demographic processes in South Asian populations”
(“Adaptatiivsete tunnuste geneetika ja soo-spetsiifilised demograafilised protsessid Lõuna-Aasia populatsioonides”)
Info DSpace'is
Eriala: molekulaarbioloogia
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Juhendajad: TÜ LOMR arheogeneetika professor Richard Villems ning TÜ LOMR külalisprofessor ja Cambridge’i Ülikooli lektor Toomas Kivisild
Oponent: Doktor Sandra Beleza, Leicester’i Ülikooli lektor, Leicester, Suurbritannia
 

Aeg ja koht: teisipäev, 09.06.2015 kell 15.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: Studies on artificial and extracellular matrix protein-rich surfaces as regulators of cell growth and differentiation
(Kunstlike ja rakuvälise maatriksi valkudega kaetud pindade osa rakkude kasvu ja diferentseerumise reguleerimises)
DSpace
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendajad: LOMR dotsent Sulev Ingerpuu, LOMR professor Toivo Maimets, LOMR vanemteadur Viljar Jaks
Oponent: professor dr Gerd Klein, Tübingeni Ülikool, Meditsiiniuuringute Keskus, Saksamaa

Aeg ja koht: kolmapäev, 17.06.2015 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "Exploiting high-throughput data for establishing relationships between genes"  
(Suuremahuliste andmete kasutamine geenidevaheliste seoste leidmiseks)
DSpace
Õppekava: geenitehnoloogia  
Eriala: bioinformaatika
Juhendajad: LOMR professor Juhan Sedman, ATI professor Jaak Vilo
Oponent: professor Boris Lenhard, Imperial College London, Suurbritannia

Aeg ja koht: kolmapäev, 26.08.2015 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "Analysis and visualisation of large scale microarray data" 
("Paljude mikrokiibi andmestike suuremahuline analüüsimine ja visualiseerimine")
DSpace
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Juhendajad: TÜ ATI professor Jaak Vilo ja LOMR professor Juhan Sedman
Oponent: Dr Gabriella Rustici, EMBL-EBI, Cambridge'i Ülikool, Suurbritannia

Aeg ja koht: neljapäev, 27.08.2015 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "Classification and identification of conopeptides using profile hidden Markov models and position-specific scoring matrices"
("Konopeptiidide klassifitseerimine ja kindlakstegemine varjatud Markovi mudelite ja positsioonisoetsiifiliste skoorimaatriksite abil")
DSpace
Õppekava: geenitehnoloogia  
Eriala: bioinformaatika
Juhendaja: LOMR professor Maido Remm
Oponent: Dr Helena Safavi-Hemami, Utah Ülikool, Salt Lake City, USA

Aeg ja koht: reede, 09.10.2015 kell 12.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: “Biochemical perspective on alphaviral nonstructural protein 2: a tale from multiple domains to enzymatic profiling”
(“Alfaviiruse nsP2 valk biokeemilisest vaatakohast: lugu mitmedomäänse valgu ensümaatilisest analüüsist”)
DSpace
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendajad: TÜ LOTI rakendusviroloogia professor Andres Merits ja teadur Aleksei Lulla
Oponent: teadusdirektor dr. Bruno Canard, CNRS, Aix Marseille Ülikool, Marseille, Prantsusmaa

Aeg ja koht: reede, 16.10.2015 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: “Computational methods for DNA copy number detection”
(“Arvutuslikud meetodid DNA koopiaarvu määramiseks”)
DSpace
Õppekava: geenitehnoloogia  
Eriala: bioinformaatika
Juhendaja: LOMR professor Maido Remm
Oponent: lektor dr. Lars Feuk, Uppsala Ülikooli Immunoloogia, Geneetika ja Patoloogia osakond, Uppsala, Rootsi

Aeg ja koht: reede, 23.10.2015 kell 10.15 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: “Combating DNA damage and maintenance of genome integrity in pseudomonads”
(“DNA kahjustuste reparatsioon ja genoomi terviklikkuse tagamine pseudomonaadides”)
DSpace
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Juhendaja: LOMR professor Maia Kivisaar
Oponent: prof. Tone Tonjum,  Oslo Ülikooli  Kliinilise Meditsiini Instituut, Oslo Ülikooli Kliinikum, Oslo, Norra 

Aeg ja koht: esmaspäev, 13. jaanuar 2014 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium) 
Doktoritöö teema: "Development of arrayed primer extension microarray assays for molecular diagnostic applications"
Eriala: molekulaardiagnostika
Õppekava: geenitehnoloogia
Juhendaja: LOMR biotehnoloogia professor Andres Metspalu
Oponent: Professor Aarno Palotie, Wellcome Trust Sangeri Instituut ja Soome Molekulaarse Meditsiini Instituut, Helsinki Ülikool, Helsinki, Soome 
DSpace

Aeg ja koht: reede, 17. jaanuar 2014 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium) 
Doktoritöö teema: "The horizontal gene pool for aromatics degradation: bacterial catabolic plasmids of the Baltic Sea aquatic system" 
Eriala: geneetika
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Juhendajad: LOMR geneetika professor Ain Heinaru ja geneetika vanemteadur Eve Vedler
Oponent: Professor Kornelia Smalla, Julius Kühn'i Instituut, Föderaalne Kultuurtaimede Uurimiskeskus, Epidemioloogia ja Patogeenide Diagnostika Instituut, Braunschweig, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht: teisipäev, 13. mai 2014 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium) 
Doktoritöö teema: „Global and fine-scale genetic determinants of recurrent pregnancy loss“
Eriala: geenitehnoloogia
Õppekava: geenitehnoloogia
Juhendaja: Maris Laan, TÜ LOMR inimese molekulaargeneetika professor
Oponent: Daniel Vaiman, professor, INSERM, Biomeditsiiniline Uurimisinstituut, Pariis, Prantsusmaa
DSpace

 

Aeg ja koht: teisipäev, 17. juuni 2014 kell 13.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B  auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditorium)
Doktoritöö teema: “RNA-Dependent RNA Polymerase Activity as a Basis for the Detection of Positive-Strand RNA Viruses by Vertebrate Host Cells"
Eriala: viroloogia
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Juhendaja: TÜ TI biomeditsiinitehnoloogia professor Mart Ustav
Oponent: Volker Lohmann, Heidelbergi Ülikool, Infektsioonhaiguste Teaduskond, Molekulaarse viroloogia osakond, Heidelberg, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht: neljapäev, 13. november 2014 kell 10.00 
Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B  auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditorium)
Doktoritöö teema: „Chromosomal microarray analysis as diagnostic tool: Estonian experience“
Eriala: molekulaardiagnostika
Õppekava: geenitehnoloogia
Juhendajad: TÜ LOMR molekulaarse biotehnoloogia professor Ants Kurg ja TÜ ARLA kliinilise geneetika professor Katrin Õunap
Oponent: Dr. rer. nat. Hartmut Engels, Tsütogeneetika- ja molekulaarse tsütogeneetilise diagnostika laboratooriumi juhataja, Inimesegeneetika Instituut, Bonni Ülikool, Bonn, Saksamaa Liitvabariik
DSpace
 

Aeg ja koht: kolmapäev, 17.detsember 2014 kell 10.00
Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23B  auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditorium)
Doktoritöö teema: „Mitochondria as integral modulators of cellular signaling“
Eriala: biokeemia
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Juhendaja: TÜ LOMR biokeemia professor Juhan Sedman
Oponent: Professor Xin Jie Chen, Upstate’i Meditsiini Ülikool, Syracuse, New York, USA
DSpace

Aeg ja koht: teisipäev, 23. aprill 2013 kell 14.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
“Platsenta geeniekspressioon normaalse ja komplitseeritud raseduse korral”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendaja: TÜ LOMR inimese molekulaargeneetika professor Maris Laan
Oponent: professor Miguel Constancia, Cambridge'i Ülikool, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht: teisipäev, 7. mai 2013 kell 12.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: “Studies on DNA replication initiation in Saccharomyces cerevisiae”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendaja: LOMR vanemteadur Arnold Kristjuhan
Oponent: Doktor John Diffley, Ühendkuningriigi Vähiuurimise Keskus (Cancer Research UK), Londoni Uurimisinstituut, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht: esmaspäev, 26. august 2013 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: High-pressure spectroscopy study of chromophore-binding hydrogen bonds in light-harvesting complexes of photosynthetic bacteria
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: biokeemia
Juhendaja: LOMR biofüüsika ja taimefüsioloogia professor Arvi Freiberg
Oponent: professor Roland Winter, Dortmundi Ülikool, Saksamaa
DSpace
 

Aeg ja koht: neljapäev, 29. august 2013 kell 14.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "Substrate specificity of the multisite specific pseudouridine synthase RluD"
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: molekulaarbioloogia professor Jaanus Remme ja molekulaarbioloogia vanemteadur Aivar Liiv, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: dotsent Petr V. Sergiev, Keemia teaduskond, Moskva Ülikool, Vene Föderatsioon
DSpace

Aeg ja koht: kolmapäev, 11. september 2013 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditorium 105 (Eesti Biokeskuse auditorium)
Doktoritöö teema „The application of oligonucleotide hybridization model for PCR and microarray optimization”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Juhendaja: LOMR bioinformaatika professor Maido Remm
Oponent: teadur Aleksander Pozhitkov, Peridontoloogia osakond, Washingtoni Ülikool, Seattle, Ameerika Ühendriigid
DSpace

Aeg ja koht: reede, 27. september 2013 kell 14.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditorium)
Doktoritöö teema: “Distribution and phylogeny of the bacterial translational GTPases and the Mqsr/YgiT regulatory system”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Juhendajad: LOMR bioinformaatika professor Maido Remm ja LOTI antimikroobsete ainete tehnoloogia professor Tanel Tenson
Oponent: professor Charles G. Kurland, Lundi Ülikool, Lund, Rootsi Kuningriik
DSpace

 

Aeg ja koht: neljapäev, 24. oktoober 2013 kell 15.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23B auditoorium 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium)
Doktoritöö teema: "Animal model of Wolfram Syndrome in mice: behavioural, biochemical, and psychopharmacological characterization" 
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: arengubioloogia
Juhendajad: inimese füsioloogia professor Eero Vasar ja füsioloogilise genoomika professor Sulev Kõks (TÜ, arstiteaduskond, bio- ja siirdemeditsiini instituut), arengubioloogia professor Alar Karis, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: dotsent Atso Raasmaja, Helsinki Ülikooli Farmaatsia teaduskond, Farmakoloogia teaduskond, Farmakoloogia ja Toksikoloogia osakond, Helsinki, Soome
DSpace
 

Kaitseb: Georgi Hudjašov
Aeg ja koht: neljapäev, 7. november 2013 kell 12.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B auditooriumis 105 (Eesti Biokeskuse auditoorium) 
Doktoritöö teema: "Maps of mitochondrial DNA, Y chromosome and tyrosinase variation in Eurasian and Oceanian populations"
Eriala: molekulaarbioloogia
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Juhendajad: LOMR külalisprofessor ja Cambridge'i Ülikooli õppejõud Toomas Kivisild ja LOMR arheogeneetika professor Richard Villems
Oponent: Professor Peter de Knijff, Inimesegeneetika osakond, Leideni Ülikooli Meditsiinikeskus, Leideni Ülikool, Holland
DSpace

Aeg ja koht: reede, 18. mai 2012 kell 12.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„Alphaviral nonstructural protease and its polyprotein substrate: arrangements for the perfect marriage“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: viroloogia
Juhendaja: TÜ TI professor Andres Merits
Oponent: Professor Ilya Frolov, Alabama Ülikooli mikrobioloogia ja immunoloogia teaduskond, Birmingham, Ameerika Ühendriigid
DSpace

Aeg ja koht: esmaspäev, 11. juuni 2012 kell 13.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„Different genetic perspectives on human history in Europe and the Caucasus: the stories told by uniparental and autosomal markers“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: TÜ LOMR arheogeneetika professor Richard Villems ja Eesti Biokeskuse vanemteadur Siiri Rootsi
Oponent: Professor Antti Sajantila, Kohtumeditsiini osakond, Hjelt Instituut, Helsingi Ülikool, Soome Vabariik 
DSpace

Aeg ja koht: reede, 15. juuni 2012 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
“The application of tmRNA as a marker molecule in bacterial diagnostics using microarray and biosensor technology”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: biotehnoloogia
Juhendaja: TÜ LOMR molekulaarse biotehnoloogia professor Ants Kurg
Oponent: Doktor Till Bachmann, Biokiipide uurimisgrupi juht, Biomeditsiiniteaduste kool, Edinburgh’i Ülikool, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht: reede, 22. juuni 2012 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„Studies on the functions of tumor-associated mucin-like leukosialin (CD43) in human cancer cells“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendajad: TÜ LOMR rakubioloogia professor Toivo Maimets ja rakubioloogia teadur Lilian Kadaja-Saarepuu
Oponent: Professor Galina Selivanova, Mikrobioloogia ning Kasvaja- ja rakubioloogia Keskus, Karolinska Instituut, Stockholm, Rootsi Kuningriik
DSpace

Aeg ja koht: neljapäeval, 23. augustil 2012. aastal kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„Improvement of PCR primer design for detection of prokaryotic species”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: bioinformaatika
Juhendaja: prof. Maido Remm, PhD, TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut, bioinformaatika õppetool, bioinformaatika professor
Oponent: vanemteadur Martine Petronella Bos, Meditsiinilise mikrobioloogia ja infetsiooni kontrolli osakond, Amsterdami Vaba Ülikooli Meditsiinikeskus, Amsterdam, Hollandi Kuningriik
DSpace

Aeg ja koht: reede, 24. august 2012 kell 14.00 Eesti Biokeskuse auditooriumis 105, Riia 23b
Doktoritöö teema:
”Modifier view of the bacterial ribosome”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: TÜ LOMR molekulaarbioloogia professor  Jaanus Remme ja vanemteadur  Aivar Liiv
Oponent: professor Roland K. Hartmann, Farmatseutilise Keemia Instituut, Philipps’i Ülikool Marburgis, Marburg, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht: reede, 7. september 2012 kell 12.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
"Overcoming the plasma membrane barrier: uptake of amphipathic cell-penetrating peptides induces influx of calcium ions and downstream responses"
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendaja: TÜ LOMR arengubioloogia professor Margus Pooga
Oponent: Professor Roland Brock, Molekulaarse Eluteaduse Keskus, Nijmegen’i Radboundi Ülikool, Nijmegen, Hollandi Kuningriik
DSpace

Aeg ja koht: reede, 14. september 2012 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
“Exploring the genomics of cognitive impairment: whole-genome SNP genotyping experience in Estonian patients and general population”
(“ Intellektipuude genoomsed põhjused: kogu-genoomi SNP genotüpiseerimisanalüüs Eesti patsientidel ja üldpopulatsioonis”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendaja: TÜ LOMR molekulaarse biotehnoloogia professor Ants Kurg
Oponent: Doktor Reinhard Ullmann, Inimese Molekulaargeneetika Osakond, Max Planck’i nimeline Molekulaargeneetika Instituut, Berliin, Saksamaa Liitvabariik
DSpace

Aeg ja koht: teisipäev, 25. september 2012 kell 14.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„Levansucrases encoded in the genome of Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000: heterologous expression, biochemical characterization, mutational analysis and spectrum of polymerization products“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Juhendaja: TÜ LOMR mikrobioloogia dotsent Tiina Alamäe
Oponent: Professor Maija Tenkanen, Helsingi Ülikool
DSpace

Aeg ja koht: reede, 19. oktoober 2012 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B (Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema:
„Studies on Semliki Forest virus replication and pathogenesis“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: viroloogia
Juhendaja: TÜ tehnoloogiainstituudi rakendusviroloogia professor Andres Merits
Oponent: Dotsent Gorben Peter Pijlman, Wageningen’i Ülikool, Wageningen, Hollandi Kuningriik
DSpace

Aeg ja koht: reede, 19. oktoober 2012 kell 16.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23B (Eesti Biokeskuse auditoorium, ruum nr 105)
Doktoritöö teema:
“Novel applications of SNP array data in the analysis of the genetic structure of Europeans and in genetic association studies”
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: geenitehnoloogia
Juhendaja: TÜ LOMR biotehnoloogia professor ja TÜ Eesti Geenivaramu direktor Andres Metspalu
Oponent: professor Tiina Paunio, Helsinki Ülikool, Soome Vabariik
DSpace

Aeg ja koht: reede, 16. november 2012 kell 10.00 Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23 auditooriumis 217
Doktoritöö teema:
„Regulation of virulence in plant-pathogenic pectobacteria“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: geneetika
Juhendaja: TÜ LOMR geneetika dotsent Andres Mäe
Oponent: vanemteadur Guy Condemine, Prantsusmaa Rahvuslik Teadusuuringute Keskus (CNRS), Lyon, Prantsusmaa
DSpace

Aeg ja koht: teisipäev, 20. november 2012 kell 10.15 Tartu Ülikooli peahonnes Ülikooli 18 ruumis 204
Doktoritöö teema:
"Influence of qPCR workflow on target gene enumeration from environmental samples in the case of bioremediation potential estimation"
Õppekava: keskkonnatehnoloogia (80343) mikroobsete protsesside suund
Eriala: keskkonnatehnoloogia
Juhendajad: TÜ LOOM keskkonnatehnoloogia professor Jaak Truu ja LOMR geneetika professor Ain Heinaru
Oponent: Professor Olli Heikki Tuovinen, PhD, Department of Microbiology, Ohio State University, USA
DSpace

Aeg ja koht: 21. jaanuar 2011 kell 14.00, Tartu Ülikooli Molekulaar-  ja rakubioloogia instituut, Riia 23-217
Doktoritöö teema:
„ColR-ColS signalling system and transposition of Tn4652 in the adaptation of Pseudomonas putida"
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituudi vanemteadur Rita Hõrak ja mikroobigeneetika professor Maia Kivisaar
Oponent: Doktor Vittorio Venturi, Rahvusvaheline  Geenitehnika ja Biotehnoloogia Keskus, Trieste, Itaalia Vabariik
DSpace

Aeg ja koht: 4. mai 2011 kell 10.00,  Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23-217 Doktoritöö teema:
„Blood pressure genetics: from candidate genes to genome-wide association studies“
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Juhendajad: TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Maris Laan ja vanemteadur Tarmo Annilo
Oponent: Professor Harold Snieder, Geneetilise Epidemioloogia ja Bioinformaatika Üksus, Gröningeni Ülikooli Meditsiinikeskus, Gröningeni Ülikool, Hollandi Kuningriik
DSpace

Aeg ja koht: 11. mai 2011 kell 10.00, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23-217 Doktoritöö teema:  
“Studies on the role of helix 69 of 23S rRNA in the factor-dependent stages of translation initiation, elongation, and termination”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituudi vanemteadur Aivar Liiv ja professor Jaanus Remme
Oponent: Professor Claudio O. Gualerzi, Looma ja Rakulise Molekulaarbioloogia Osakond, Camerino Ülikool, Camerino, Itaalia Vabariik
DSpace

Aeg ja koht: 2. juuni 2011 kell 10.00, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituut, Riia 23-217
Doktoritöö teema:
“Effect of antibiotics on ribosome assembly is indirect”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad:  TÜ MRI professor Jaanus Remme  ja TÜ TI professor Tanel Tenson
Oponent: Professor James Russell Williamson, Scripps’i Uurimisinstituut, Kalifornia, Ameerika Ühendriigid
DSpace

Aeg ja koht: 13. juunil 2011 kell 10.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
"Identification and molecular analysis of the role of guanine nucleotide exchange factor RIC-8 in mouse development and neural function”
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: arengubioloogia
Juhendajad:  TÜ MRI professorid Alar Karis ja Margus Pooga
Oponent: Professor Juha Partanen, Helsingi Ülikooli Biotehnoloogia Instituut, Helsingi, Soome Vabariik
DSpace

Aeg ja koht: 15. juunil 2011 kell 10.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
"Multiple faces of cell-penetrating peptides – their intracellular trafficking, stability and endosomal escape during protein transduction"
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: rakubioloogia
Juhendaja:  TÜ MRI professor Margus Pooga
Oponent: Professor John Howl, Wolverhamptoni Ülikool, Wolverhampton, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht: 22. augustil 2011. aastal kell 14.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
”Genetic predisposition to nonsyndromic orofacial clefts”
(”Mittesündroomsete suulõhede geneetiline eelsoodumus”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendaja:  TÜ MRI professor Andres Metspalu
Oponent: Alexandre Rezende Vieira, Pittsburgh'i Ülikool, USA
DSpace

Aeg ja koht: 23. augustil 2011. aastal kell 12.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217
Ddoktoritöö teema: 
“Studies on the mechanisms of RNA polymerase II-dependent transcription elongation"
("RNA polümeraas II-sõltuva transkriptsiooni elongatsiooni mehhanismide uurimine")
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: transgeenne tehnoloogia
Juhendaja:  TÜ MRI vanemteadur Arnold Kristjuhan
Oponent: Professor Thomas A. Owen-Hughes, Dundee Ülikool, Šotimaa, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht: 25. augustil 2011. aastal kell 12.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:
“Gene expression profiling and genome-wide association studies of non-small cell lung cancer” 
(“Mitteväikerakulise kopsuvähi kogu genoomi geeniekspressiooni- ja assotsiatsiooniuuringud”)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendaja:  TÜ MRI professor Andres Metspalu
Oponent: Doktor Jörg Hoheisel, Funktsionaalse Genoomianalüüsi Osakond, Saksa Vähiuuringute Keskus, Heidelberg, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht: 25. novembril 2011. aastal kell 14.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia Instituudis Riia 23-217
Doktoritöö teema:  
„Fine-scale genetic variation of follicle-stimulating hormone beta-subunit coding gene (FSHB) and its association with reproductive health“ („Folliikuleid-stimuleeriva hormooni beeta-alaühikut kodeeriva geeni (FSHB) järjestuse varieeruvus ja selle seos reproduktiivtervisega“)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarne biomeditsiin
Juhendaja:  TÜ MRI professor Maris Laan
Oponent: Professor Ilpo Huhtaniemi, Paljunemise- ja Arengubioloogia Instituut, Londoni Riiklik Kolledž, London, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht:  29. jaanuaril 2010 kell 14.00 Riia 23-217 TÜ Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituudis
Teema:"Genomics and transcriptomics of human induced ovarian folliculogenesis“
(„Stimuleeritud ovariaalne follikulogenees: geneetiliste faktorite uuring“)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendajad:TÜ MRI professor Andres Metspalu ja TÜ MRI biotehnoloogia õppetooli vanemteadur Andres Salumets
Oponent: Dotsent Antti Perheentupa, Turu Ülikool, Turu, Soome Vabariik
DSpace
 

Aeg ja koht: 12. märtsil 2010 kell 14.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis 
Teema:"Photosynthetic cyclic electron transport – measurement and variably proton-coupled mechanism" (Tsükliline elektrontransport taimedes – selle mõõtmine ning mehhanism)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: taimefüsioloogia 
Juhendajad: TÜ MRI vanemteadur Agu Laisk ja TÜ MRI vanemteadur Vello Oja
Oponent: Dotsent Giles Johnson, Manchesteri Ülikool, Suurbritannia
DSpace
 

Aeg ja koht: 9. aprillil 2010 kell 10.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis 
Teema: „Genetic structure of the Estonian population and genetic distance from other populations of European descent“ („Eesti populatsiooni geneetiline struktuur ja geneetiline kaugus teistest Euroopa päritolu populatsioonidest“)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendaja: TÜ MRI professor Andres Metspalu.
Oponent: Markus Perola, Rahvusliku Rahvatervise Instituudi vanemteadur ja Helsinki Ülikooli dotsent, Soome Vabariik
DSpace
 

Aeg ja koht: 4. mail 2010 kell 10.00 Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis 
Teema: Arrayed Primer Extension-2 as a multiplex PCR-based method for nucleic acid variation analysis: method and application" (Geenikiibil põhinev genotüpiseerimise meetod, APEX-2, kui paindlik lahendus DNA variatsioonide määramiseks).
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika 
Juhendaja: TÜ MRI professor Andres Metspalu.
Oponent: Dr. Ivo G. Gut, Rahvuslik Genoomianalüüsi Keskus, Barcelona, Hispaania Kuningriik
DSpace
 

Aeg ja koht:  21. juunil kell 10.00 Riia 23-217 TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis
Teema: "Diversity of key catabolic genes at degradation of phenol and p-cresol in pseudomonads“
(„Kataboolsete võtmeensüüme kodeerivate geenide mitmekesisus fenooli ja p-kresooli lagundamisel pseudomonaadides“)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: mikrobioloogia
Juhendaja: TÜ MRI professor Ain Heinaru
Oponent: Professor Hermann J. Heipieper, Helmholz'i Keskkonnauuringute Keskus, Leipzig, Saksamaa
DSpace
 

Aeg ja koht:  21. juunil kell 14.15 Ülikooli 18-204
Teema:"Impact of phytoremediation and bioaugmentation on the microbial community in oil shale chemical industry solid waste“
(„Fütoremediatsiooni ja bioaugmentatsiooni mõju poolkoksi mikroobikooslusele“)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: keskkonnatehnoloogia
Juhendaja: TÜ MRI vanemteadur Jaak Truu, PhD
Oponent: Kim Yrjäla, PhD, (Department of Biological and Environmental Sciences, University of Helsinki)
DSpace
 

Aeg ja koht: 27. august kell 12.15 
Teema:"Studies on bacterial ribosomes by chemical modification approaches"
("Bakteri ribosoomide uurimus keemilise modifitseerimise meetoditega") 
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: transgeenne tehnoloogia
Juhendaja: TÜ MRI professor Jaanus Remme
Oponent: Dotsent Norbert Polacek, Innsbruck'i Meditsiini Ülikool, Innsbruck, Austria Vabariik
DSpace
 

Aeg ja koht: 17. septembril kell 12.00 
Teema: "Study of the segregation mechanism of the Bovine Papillomavirus Type 1"  (Veise papilloomiviiruse tüüp 1 segregatsioonimehhanismi uurimine)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: viroloogia
Juhendajad: Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituudi professor Mart Ustav ja Eesti Biokeskuse erakorraline vanemteadur Aare Abroi.
Oponent: Professor Cheng-Ming Chiang, Texase Ülikooli Kagu Meditsiinikeskus, Dallas, Texas, Ameerika Ühendriigid
DSpace

Aeg ja koht: 20. septembril kell 14.00 
Teema: "The demographic history of India: a perspective based on genetic evidence" (India demograafiline ajalugu: pilt läbi geneetilise andmestiku)
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: molekulaarbioloogia
Juhendajad: TÜ MRI professor (peatatud) ja Eesti Biokeskuse vanemteadur Toomas Kivisild ja TÜ MRI vanemteadur Ene Metspalu
Oponent: Professor Jaume Bertranpetit Busquets, Pompeu Fabra Ülikool, Eksperimentaalse ja Terviseteaduse Osakond, Evolutsioonilise Bioloogia Instituut, Barcelona, Kataloonia, Hispaania Kuningriik
DSpace
 

Aeg ja koht: 19. novembril 2010 kell 12.00 
Teema: "Genes involved in cardiovascular traits: detection of genetic variation in Estonian and Czech populations"(Südameveresoonkonna funktsioonis osalevad geenid: uued pärilikud DNA variandid Eesti ja Tšehhi populatsioonides)
Õppekava: geenitehnoloogia
Eriala: molekulaardiagnostika
Juhendaja: TÜ MRI professor Maris Laan
Oponent: Professor Kimmo Kontula, Helsingi Ülikool, Soome Vabariik
Dspace

Aeg ja koht: 20. detsembril 2010 kell 13.00 
Teema:"Replication and Recombination of mitochondrial DNA in Yeast"
 ("Mitokondriaalse DNA replikatsioon ja rekombinatsioon pärmis") 
Õppekava: molekulaar- ja rakubioloogia
Eriala: biokeemia
Juhendaja: TÜ MRI professor Juhan Sedman
Oponent: Professor Howard T. Jacobs, Tampere Ülikool, Soome Vabariik
DSpace

Aeg ja koht:  17. märtsil 2009 kell 14.00 Puusepa 8 - Linkbergi nim auditooriumis
Teema: "The genetic causes of mental retardation in Estonia: fragile X syndrome and creatine transporter defect"
("Vaimse arengu mahajäämuse geneetilised põhjused Eestis: fragiilne X sündroom ja kreatiini transporteri defekt").
Juhendajad: dots Katrin Õunap (TÜ lastekliinik) ja prof Ants Kurg (TÜ molekulaar- ja rakubioloogia instituut).
Oponent: prof Ben Hamel (Radboud University Nijmegen Medical Centre, Holland)
DSpace


 

Aeg ja koht:  25. märts 2009  kell 14:00 L.Puusepa 8 (A.Linkbergi nim. auditoorium)
Teema: "Inimese kooriongonadotropiini beeta alaühiku geenide ekspressioon ja varieeruvus ning korduv raseduse iseeneslik katkemine"
Juhendajad: Prof.Maris Laan, Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Tartu Ülikool; Prof. Helle Karro, Sünnitusabi ja günekoloogia õppetool, Tartu Ülikooli Naistekliinik
Oponent: Prof. Marek Zygmunt, Greifswaldi Ernst-Moritz-Arndt nimeline ülikool
DSpace

Aeg ja koht:  Reedel, 27. märtsil kell 15.15 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: „Sequence motifs influencing the efficiency of translation“
(„Translatsiooni efektiivust mõjutavad järjestuse motiivid“)
Juhendajad: TÜ MRI prof. Maido Remm ja TÜ LOTI prof. Tanel Tenson
Oponent: Dr. Manuel Santos (Ph.D.), Aveiro Ülikoolist, Aveiro, Portugal
DSpace

Aeg ja koht:  Reedel, 17. aprillil – kell 12.15 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “The role of specialized DNA polymerases in mutagenesis in Pseudomonas putida“
("Spetsialiseerunud DNA polümeraaside roll Pseudomonas putida rakkudes toimuvates mutatsiooniprotsessides")
Juhendajad: TÜ MRI prof. Maia Kivisaar ja Quattromed Cell Factory teadusdirektor Andres Tover
Oponent: Dr. Jesús Blázquez, Centro Nacional de Biotecnolog?a (CNB), Cantoblanco, Madriid, Hispaania
DSpace

Aeg ja koht:  Neljapäeval, 30. aprillil kell 9.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “Semliki Forest virus based vectors and cell lines for studies of replication and interactions of Alphaviruses and Hepaciviruses”
(Semliki Forest viirusel põhinevad vektorid ja rakuliinid alfaviiruste ja hepatsiviiruste replikatsiooni ning interaktsioonide uurimisel)
Juhendaja: TÜ TI professor Andres Merits
Oponent: Professor Ari E. Hinkkanen, Kuopio Ülikooli Biotehnoloogia ja Molekulaarse Meditsiini osakond, Kuopio, Soome
DSpace

Aeg ja koht:  Neljapäeval, 30. aprillil kell 12.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: „Papillomavirus Replication Machinery Induces Genomic Instability in its Host Cell“
(„Papilloomiviiruse DNA replikatsioon põhjustab peremeesrakus geneetilist ebastabiilsust“)
Juhendaja: TÜ TI professor Mart Ustav
Oponent: Prof. Michael Botchan, Kalifornia Ülikoolist, Berkeley, Ameerika Ühendriigid
DSpace

Aeg ja koht:  Neljapäeval, 7. mail kell 10.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “Human and chimpanzee Luteinizing Hormone/ Chorionic Gonadotropin Beta (LHB/CGB) gene clusters: diversity and divergence of young duplicated genes"
(”Inimese ja šimpansi Luteiniseeriva Hormooni/ Koorion Gonadotropiini Beeta (LHB/CGB) geeniklaster: liigisisene varieeruvus ning noorte duplitseeritud geenide lahknemine sõsar-liikides“)
Juhendaja: TÜ MRI erakorraline professor Maris Laan
Oponent: Prof. John Armour, Nottinghami Ülikoolist, Queen'si Meditsiinikeskusest, Nottinghamist, Suurbritannia
DSpace

Aeg ja koht:  Teisipäeval, 30. juunil kell 10.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “The Role of Endocytosis in the Protein Transduction by Cell-Penetrating Peptides”
(“Endosomaalsed rajad rakku sisenevate peptiididega vahendatud valgutranspordil“)
Juhendaja: TÜ MRI professor Margus Pooga
Oponent: Dr. Arwyn Tomos Jones, Cardiff'i Ülikool, Cardiff, Suurbritannia 
DSpace
 

Aeg ja koht:  Neljapäeval, 3. septembril – kell 10.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “Ribosome assembly factors in Escherichia coli"
("Ribosoomide kokkupakkimise faktorid soolekepikeses Escherichia coli")
Juhendaja: TÜ MRI prof. Jaanus Remme
Oponent: Dr. Daniel N. Wilson, Müncheni Geenikeskus, Müncheni Ludwig-Maximiliani Ülikool, München, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht:  Reedel, 20. novembril – kell 12.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: “Mutagenic potential of DNA damage repair and tolerance mechanisms under starvation stress”
(“DNA kahjustuste parandamis- ja talumismehhanismide osalus nälgivates bakterirakkudes toimuvates mutatsiooniprotsessides“)
Juhendaja: TÜ MRI prof. Maia Kivisaar
Oponent: Prof. Caroline Kisker, Rudolf Virchowi Keskus, Würzburg, Saksamaa
DSpace
 

Aeg ja koht: Neljapäeval, 17. detsembril kell 12.00 TÜMRIs Riia 23-217 
Teema: „Molecular variation of HIV-1 and the use of this knowledge in vaccine development“
(„HI-viiruse molekulaarne varieeruvus ja selle teadmise kasutamine vaktsiini väljatöötamisel“) (molekulaarbioloogia eriala)
Juhendajad: TÜ MRI erakorraline professor Richard Villems ja TÜ TI professor Mart Ustav
Oponent: Professor Paul Pumpens, Läti Biomeditsiiniliste Uuringute Keskus, Riia, Läti Vabariik
DSpace

Aeg ja koht: 18. detsember 2008 kl 14.15 TÜ nõukogu saalis
Teema "Impact of land use on microbial communities in Estonian soils"
(PhD kraadi saamiseks keskkonnatehnoloogia erialal)
Juhendajad: TÜ MRI vanemteadur Jaak Truu, TTÜ Tartu Kolledzi prof. Mari Ivask
Oponent: dotsent Per-Eric Lindgren, Linköpingi Ülikool, Rootsi
DSpace

Aeg ja koht: reedel, 28. novembril 2008 kell 12.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: "Responses of Pseudomonas putida to phenol-induced metabolic and stress signals”
(„Pseudomonas putida vastused fenoolist tulenevatele metabolismi- ja stressisignaalidele”)
Juhendaja: TÜ MRI prof. Maia Kivisaar ja vanemteadur Rita Hõrak
Oponent: professor Juan L. Ramos, Estacion del Zaidin, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas, Granada, Hispaania
DSpace

Aeg ja koht: reedel, 21. novembril 2008 kell 10.00 TÜMRIs Riia 23-217
Teema: "Design, functionalization and application of an in situ synthesized oligonucleotide microarray"
("In situ sünteesitud oligonukleotiidide mikrokiibi disain, funktsionaliseerimine ja rakendamine")
Juhendaja: TÜ MRI professor Andres Metspalu
Oponent: professor Joachim W. Engels, Orgaanilise Keemia Instituut, J.W. Goethe Ülikool, Frankfurt Maini ääres, Saksamaa
DSpace

Aeg ja koht    Esmaspäev, 25. august, kl 12.00 TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: “Studies on the stress-inducible pseudokinase TRB3, a novel inhibitor of transcription factor ATF4”.
("Uurimus stressi poolt indutseeritavast pseudokinaasist TRB3, transkriptsioonifaktori ATF4 uuest inhibiitorist")
Juhendaja: Eesti Biokeskuse vanemteadur Tõnis Örd ja Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia Instituudi professor Jaanus Remme
Oponent: Dotsent Laura Korhonen, Minerva Meditsiiniline Uurimisinstituut, Helsingi, Soome
DSpace

Aeg ja koht    Neljapäev, 21. august, kell 10.15 TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: “Peptide mediated macrolide resistance”.
("Peptiidide poolt vahendatud makroliidiresistentsus")
Juhendaja: Tartu Ülikooli Tehnoloogia Instituudi professor Tanel Tenson
Oponent: Dotsent Birte Vester, Lõuna-Taani Ülikool, Odense, Taani
DSpace

Aeg ja koht    Kolmapäeval, 18. juunil, kl 13 ülikooli nõukogu saalis
Teema: “Impact of biochemical parameters of genetically different pseudomonads at the degradation of phenolic compounds”
Juhendaja: prof Ain Heinaru, TÜ Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, prof Toomas Tenno, TÜ Keemia Instituut
Oponent: prof Kalevi Pihlaja, Turu Ülikool, Soome
DSpace

Aeg ja koht    Kolmapäev, 11. juuni – kell 14.00 TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: "Methods and software for predicting PCR failure rate in large genomes"
("Meetodid ja tarkvara PCR praimerite töötamise ennustamiseks suurtes genoomsetes DNA järjestustes")
Juhendaja: prof.  Maido Remm, TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Oponent: dotsent Dong Xu, Missouri Ülikool, USA
DSpace

Aeg ja koht: 14. märtsil 2008 kl 10 Vanemuise 46-301
Teema: "Protein transduction mechanisms of transportans"
Juhendajad: vanemteadur Margus Pooga, PhD, erak. prof. Jüri Kärner, PhD, TÜ MRI
Oponent: prof. Gilles Divita, Montpellier'i Ülikool, Makromolekulaarse Biokeemia Uurimiskeskus, Prantsusmaa
DSpace

"Development and Evaluation of a Filter-Bed-Based System for Full-Scale Treatment of Industrial Landfill Leachate"
Juhendajad: Lennart Mathiasson, William Hogland, Ain Heinaru
Oponent: prof Rune Bakke, Telmark University College, Norway
Kaitstud: Center for Chemistry and Chemical Engineering, Lund University, Sweden, 27th September 2008

Aeg ja koht   Reedel, 23. novembril 2007.a. kell 11, TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: "The role of DNA mismatch repair and oxidative DNA damage defense systems in avoidance of stationary phase mutations in Pseudomonas putida"
("DNA paardumisvigade reparatsiooni ja DNA oksüdatiivsete kahjustuste kaitsesüsteemide roll statsionaarse faasi mutatsioonide ärahoidmisel bakteris Pseudomonas putida")
Juhendaja: dotsent Maia Kivisaar (TÜMRI)
Oponent: Prof. Elzbieta Grzesiuk, (Biokeemia ja Biofüüsika Instituut, Varssav, Poola)
DSpace
 

Aeg ja koht   Reedel 30. novembril 2007.a. kell 10.00, TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: "The linkage disequilibrium and the selection of genetic markers for association studies in European populations"
("Alleelne aheldatus ja geneetiliste markerite valik assotsiatsioonianalüüside läbiviimiseks Euroopa populatsioonides")
Juhendaja: prof  Maido Remm (TÜMRI)
Oponent: Dr. Suzanne Eyheramendy, (Rahvuslik Tervise ja Keskkonna Uurimiskeskus, Epidemioloogia Instituut, München, Saksamaa)
DSpace

Aeg ja koht   Kolmapäeval, 20 juunil kell 10.15 TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: "Replication strategies and applications of Semliki Forest virus"
("Semliki Forest viiruse replikatsiooni strateegiad ja rakendused")
Juhendaja: prof  Andres Merits (TÜ Tehnoloogiainstituut)
Oponent: Dr. Maarit Suomalainen (Haartman'i Instituut, Helsingi, Soome)
DSpace

Aeg ja koht   Esmaspäeval, 15. jaanuaril kell 14.15 TÜMRI's, Riia 23-217
Teema: "Studies of the mitochondrial helicase Hmi1p in Candida albicans and Saccharomyces cerevisiae"
("Mitokondriaalse helikaasi Hmi1p uuringud pärmides Candida albicans ja Saccharomyces cerevisiae")
Juhendaja: prof  Juhan Sedman
Oponent: dotsent Lubomir Tomaska, PhD (Comeniuse Ülikool, Bratislava, Slovakkia)
DSpace

Juhendajad: Prof. Marjo Salminen, Biotehnoloogia Instituut, Helsingi Ülikool, Prof. Alar Karis, Eesti Maaülikool 
Oponent: Prof. Scott F. Gilbert, Swarthmore College, PA, USA.
Kaitstud TÜ Zooloogia- ja Hüdrobioloogia Instituudi nõukogus

Aeg ja koht Teisipäeval, 27. juunil kell 14.15 TÜMRI's, Riia 23-217 
Teema: "Problem solving in web-based learning environment"
(Probleemide lahendamine veebipõhises õpikeskkonnas)
Juhendaja: dots. Tago Sarapuu, knd (bioloogia)
Oponent: prof. Ton de Jong, PhD (Twente Ülikool, Holland)
DSpace

Aeg ja koht   Reedel, 12. mai 2006, kell 15.15 TÜMRI's, Riia 23-217
Eriala:           Biokeemia
Teema: "Biochemical properties of Hmi1p, a DNA helicase from Saccharomyces cerevisiae mitochondria”
(”Pärmi Saccharomyces cerevisiae mitokondriaalse helikaasi Hmi1p biokeemilised omadused")
Juhendaja: prof. Juhan Sedman
Oponent: Dr. Françoise Foury , PhD (Catholic University of Louvain, Belgium)
DSpace

Aeg ja koht   Reedel, 17. märtsil 2006, kell 14.15 TÜMRI's, Riia 23-217
Eriala:           Molekulaarbioloogia
Teema: Stress-induced transposition of Tn4652 in Pseudomonas putida
(Pseudomonas putida transposooni Tn4652 aktiveerumine stressitingimustes)
Juhendaja: dots Maia Kivisaar, PhD ja Rita Hõrak, PhD
Oponent: prof. Dieter Haas (Lausanne Ülikool, Šveits)
DSpace

Aeg ja koht   Neljapäeval, 19. Jaanuaril , kell 14.15 TÜMRI's, Riia 23-217     
Teema:    The comparative patterns of linkage disequilibrium in European populations and its implication for genetic association studies
(”Alleelse aheldatuse (LD) struktuuri uurimine Euroopa populatsioonides ja selle rakendused geneetilistes assotsiatsiooniuuringutes”)
Juhendaja:    prof. Andres Metspalu
Oponent: prof. Aarno Palotie (Helsingi Ülikool, Soome)
DSpace 

Teema: Behavioural and neurogenetic study of mechanisms related to cat odour induced anxiety in rodents
(Kassilõhna tekitatud ärevuse mehhanismide käitumuslik ja neurogeneetiline uurimus närilistel)
Juhendajad: Prof. Toomas Asser, Arstiteaduskond, Närvikliinik, prof. Alar Karis, Zooloogia ja Hüdrobioloogia Instituut, vanemteadur Sulev Kõks, Füsioloogia Instituut, Tartu Ülikool
Oponent: dotsent Atso Raasmaja, Helsingi Ülikool, Soome

Kaitstud Tartu Ülikooli arstiteaduskonnas.
DSpace

Aeg ja koht    Esmaspäeval, 19. detsembril, kell 14.15 TÜMRI's, Riia 23-217      
Teema:    Through the course of prehistory in India: tracing the mtDNA trail
”India eelajaloo käsitlus mtDNA vaatevinklis”
Juhendaja:    erakorraline prof. Richard Villems ja prof. Toomas Kivisild      
Oponent:    Antonio Salas Ellacuriaga, PhD (University of Santiago de Compostela, Spain)
DSpace

Aeg ja koht    Reedel, 9. detsembril 2005, kell 10.15 TÜMRI's, Riia 23-217      
Teema:    Regulation of transcription from the fusion promoters generated by transposition of Tn4652 into the upstream region of pheBA operon in Pseudomonas putida
"Tn4652 transponeerumisel pheBA operoni ette tekkinud liitpromootoritelt lähtuva transkriptsiooni regulatsioon Pseudomonas putida´s”
Juhendaja:   dots. Maia Kivisaar, PhD      
Oponent:    Suvi Taira, PhD (Helsingi Ülikool, Soome)
DSpace
 

#instituudist #ülikoolist
MR podcasti salvestuse pilt3 (3.09.2021 Ermo Leuska).jpg

Salvestused (sh inaguratsiooniloengud)

21.09.2022
#instituudist
Tartu ülikooli õppehoone Aia (Vanemuise) t. 46 1930-ndatel

Õppeaasta avaaktus 29.08 kell 12.15

17.08.2022
#instituudist #kultuur #teadus #ühiskonnale #ülikoolist
MR Omicumi galerii vaade 21022022 Teele Eensaar

Omicumi galerii

04.07.2022