-
Humanitaarteaduste ja kunstide valdkondHumanitaarteaduste ja kunstide valdkonna dekanaatJakobi 2, r 116-121 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Ajaloo ja arheoloogia instituutJakobi 2 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Eesti ja üldkeeleteaduse instituutJakobi 2, IV korrus 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTFilosoofia ja semiootika instituutJakobi 2, III korrus, ruumid 302-337 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Kultuuriteaduste instituutÜlikooli 16 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Maailma keelte ja kultuuride instituutLossi 3 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0UsuteaduskondÜlikooli 18 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Viljandi kultuuriakadeemiaPosti 1 71004 Viljandi linn, Viljandimaa EST0Humanitaarteaduste ja kunstide valdkonna emeriitprofessorid0Humanitaarteaduste ja kunstide valdkonna emeriitdotsendid0Sotsiaalteaduste valdkondSotsiaalteaduste valdkonna dekanaatLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Haridusteaduste instituutJakobi 5 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Johan Skytte poliitikauuringute instituutLossi 36, ruum 301 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0MajandusteaduskondNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Psühholoogia instituutNäituse 2 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0ÕigusteaduskondNäituse 20 - 324 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Ühiskonnateaduste instituutLossi 36 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Narva kolledžRaekoja plats 2 20307 Narva linn, Ida-Virumaa EST0Pärnu kolledžRingi 35 80012 Pärnu linn, Pärnu linn, Pärnumaa EST0Sotsiaalteaduste valdkonna emeriitprofessorid0Sotsiaalteaduste valdkonna emeriitdotsendid0Meditsiiniteaduste valdkondMeditsiiniteaduste valdkonna dekanaatRavila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTBio- ja siirdemeditsiini instituutBiomeedikum, Ravila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTFarmaatsia instituutNooruse 1 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTHambaarstiteaduse instituutL. Puusepa 1a 50406 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTKliinilise meditsiini instituutL. Puusepa 8 50406 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTPeremeditsiini ja rahvatervishoiu instituutRavila 19 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTSporditeaduste ja füsioteraapia instituutUjula 4 51008 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTMeditsiiniteaduste valdkonna emeriitprofessorid0Meditsiiniteaduste valdkonna emeriitdotsendid0Loodus- ja täppisteaduste valdkondLoodus- ja täppisteaduste valdkonna dekanaatVanemuise 46 - 208 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTArvutiteaduse instituutNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTGenoomika instituutRiia 23b/2 51010 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTEesti mereinstituutMäealuse 14 12618 Tallinn, Harjumaa EST0Füüsika instituutKeemia instituutRavila 14a 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTMatemaatika ja statistika instituutNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Molekulaar- ja rakubioloogia instituutRiia 23, 23b - 134 51010 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTTartu observatooriumObservatooriumi 1 61602 Tõravere alevik, Nõo vald, Tartumaa EST0TehnoloogiainstituutNooruse 1 50411 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÖkoloogia ja maateaduste instituutJ. Liivi tn 2 50409 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTLoodus- ja täppisteaduste valdkonna emeriitprofessorid0Loodus- ja täppisteaduste valdkonna emeriitdotsendid0Akadeemilise sekretäri tegevusvaldkondPersonaliosakondÜlikooli 18, ruumid 302 ja 304 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Finantsjuhi tegevusvaldkondRahandusosakondJakobi 4 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Kantsleri tegevusvaldkondInfotehnoloogia osakondUppsala 10 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0KantseleiÜlikooli 17 (III korrus) 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Kinnisvaraosakond0Turundus- ja kommunikatsiooniosakondÜlikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Õppeprorektori tegevusvaldkondÕppeosakondTeaduskoolUppsala 10 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTÜliõpilaskonna bürooÜlikooli 18b 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Õppimis- ja õpetamiskeskusLossi 36-401 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTTeadusprorektori tegevusvaldkondRaamatukoguW. Struve 1 50091 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTGrandikeskusRaekoja plats 9, III korrus 51004 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTArendusprorektori tegevusvaldkondEttevõtlus- ja innovatsioonikeskusNarva mnt 18 51009 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Loodusmuuseum ja botaanikaaedVanemuise 46 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Rahvusvahelise koostöö ja protokolli osakond0MuuseumLossi 25 51003 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST0Rektori tegevusvaldkondRektoraadi bürooÜlikooli 18 50090 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa ESTSiseauditi büroo
Bakterite stressitaluvuse uurimisgrupp
bakterite võitlemine viiruste vastu
toksiin-antitoksiin süsteemid
Meie uuringud keskenduvad erinevatele molekulaarsetele mehhanismidele, mida bakterid kasutavad stressitingimuste üleelamiseks. Üheks bakterite elutegevuse ohustajaks on viirused ehk bakteriofaagid. Faagide vastu võitlemiseks on bakteritel mitmeid võimalusi. Bakterid võivad takistada faagi sisenemist rakku muutes pinnaretseptoreid. Paljud bakterid kodeerivad DNA restriktsiooni/modifikatsioonigeene või CRISPR-Cas süsteeme, mis tunnevad ära ja lagundavad võõr-DNA. Drastilisema võimalusena viirusevastases võitluses kasutatakse nn Abi (abortive infection) süsteeme, mille aktiveerumisel surmatakse faagiga nakatunud bakter enne viiruspartiklite küpsemist. Faagid omakorda kodeerivad mehhanisme, mis võimaldavad neil bakteri kaitsemehhanisme üle kavaldada. Seega käib bakterite ja faagide vahel pidev võidurelvastumine.
Bakterite genoomid sisaldavad arvukalt toksiin-antitoksiin süsteemide geene ja ka krüptilisi profaage. Testime võimalust, et need DNA elemendid on olulised faagivastases kaitses. Oletame, et toksiin-antitoksiin süsteemid võivad takistada rakku sisenenud faagi arengut, kuna nende süsteemide kodeeritud toksiinid võivad inhibeerida faagi replikatsiooni, transkriptsiooni või translatsiooni. Toksiin-antitoksiin lookused võivad toimida ka Abi süsteemidena ja surmata faagiga nakatunud bakteri, peatades faagi paljunemise bakteripopulatsioonis.
Päises kasutatud pilt: Pseudomonas putida faagilaigud erinevate faagide ja bakteritüvede puhul (autor: Rita Hõrak)
1. Rosendahl S, Tamman H, Brauer A, Remm M, Hõrak R. 2020. Chromosomal toxin-antitoxin systems in Pseudomonas putida are rather selfish than beneficial. Sci Rep 10:9230.
2. Talavera A, Tamman H, Ainelo A, Konijnenberg A, Hadzi S, Sobott F, Garcia-Pino A, Hõrak R, Loris R. 2019. A dual role in regulation and toxicity for the disordered N-terminus of the toxin GraT. Nat Commun 10:972.
3. Ainelo A, Porosk R, Kilk K, Rosendahl S, Remme J, Hõrak R. 2019. Pseudomonas putida Responds to the Toxin GraT by Inducing Ribosome Biogenesis Factors and Repressing TCA Cycle Enzymes. Toxins (Basel) 11.
4. Ainsaar K, Tamman H, Kasvandik S, Tenson T, Hõrak R. 2019. TonBm-PocAB system is required for maintenance of membrane integrity and polar position of flagella in Pseudomonas putida. J Bacteriol 201.
5. Hõrak R, Tamman H. 2017. Desperate times call for desperate measures: benefits and costs of toxin-antitoxin systems. Curr Genet 63:69-74.
Teenused ettevõtetele ja teadlastele
Teadmussiirdedoktorantuur on rikastav kogemus nii ülikoolile kui ka ettevõttele
